拒绝合并开票本身并不直接构成违法，但具体是否违法需结合实际情况和相关法律规定来判断。以下从不同角度为你详细分析：

一、从发票管理法规的角度

根据《中华人民共和国发票管理办法》及其相关规定，发票的开具应当遵循真实、准确、完整的原则。这意味着，发票的开具应当与实际的交易内容相符，不得虚开、伪造或变造发票。在合并开票的情况下，如果合并后的发票内容能够真实反映交易的全貌，且符合税法的规定，那么合并开票是合法的。然而，如果拒绝合并开票是因为要求单独开票的一方试图通过单独开票来规避税收、隐瞒交易真实情况或进行其他违法行为，那么这种拒绝行为可能是在维护合法的税收秩序和交易透明度，并不构成违法。

二、从合同约定的角度

在合同纠纷中，发票的开具方式往往也会作为合同的一部分进行约定。如果合同中明确规定了需要合并开票，而一方拒绝履行这一约定，那么可能构成违约行为。但违约并不等同于违法，违约行为主要依据合同法的相关规定进行处理，如承担违约责任、赔偿损失等。当然，如果合同中的约定本身违反了法律法规的强制性规定，那么该约定是无效的，此时拒绝按照无效约定开票也不构成违法。

三、从税务筹划和合规的角度

在实际操作中，有些企业或个人可能会通过合并开票或单独开票的方式进行税务筹划。然而，税务筹划必须在合法合规的框架内进行。如果拒绝合并开票是因为对方提出的合并开票方式存在税务风险或不合规之处，如可能导致税负不公、逃避税收监管等，那么这种拒绝行为是在维护自身的税务合规性，并不构成违法。

四、建议与风险提示

1. 审查合同条款：在涉及发票开具的合同中，应仔细审查相关条款，确保发票的开具方式符合法律法规和合同约定。
2. 咨询专业税务意见：在进行税务筹划或处理发票开具问题时，建议咨询专业的税务机构或税务律师，以确保操作的合法合规性。
3. 保留相关证据：在处理发票开具纠纷时，应保留好相关的交易凭证、合同、沟通记录等证据，以备不时之需。

如果你在合同纠纷中遇到了拒绝合并开票的问题，并且对此存在疑虑或担忧，可以直接向我咨询。我会根据你的具体情况，为你提供专业的法律意见和解决方案。