结论：公司有执行案件时，项目专用账户的钱是否会被执行，取决于该账户资金的性质、来源以及是否被特定法律程序所保护。以下从不同角度进行分析：

1. 资金性质与来源：

   • 如果项目专用账户中的资金属于公司正常经营所得，且未被特定法律程序（如财产保全、先予执行等）所冻结或查封，那么这些资金在理论上是可以被执行的，以偿还公司的债务或履行其他法律义务。
   • 如果资金属于特定项目或特定用途，且该用途受到法律保护（如专项基金、保证金等），或者资金来源有特殊规定（如政府补贴、专项贷款等），则可能不会被执行，或者需要满足特定条件才能执行。

2. 法律程序保护：

   • 在执行案件中，法院会根据申请执行人的请求和被执行人的财产状况，采取相应的执行措施。如果项目专用账户的资金已经被法院查封、冻结或扣划，那么这些资金将无法被公司自由支配，也无法用于其他非执行目的。
   • 另一方面，如果公司能够证明项目专用账户的资金与执行案件无关，或者该资金受到特定法律程序的保护（如诉讼保全中的异议之诉），则可能能够阻止或延缓执行。

3. 实际操作中的考量：

   • 在实际操作中，法院在执行时会综合考虑多种因素，包括资金的性质、来源、用途以及公司的经营状况等。如果项目专用账户的资金是公司维持正常运营所必需的，法院可能会采取更为谨慎的执行措施，以避免对公司造成过大影响。
   • 同时，公司也可以积极与申请执行人协商，寻求和解或分期履行等解决方案，以减轻执行压力并保护项目专用账户的资金安全。

法律建议：

• 如果公司面临执行案件，且担心项目专用账户的资金会被执行，建议及时咨询专业律师，了解相关法律规定和执行程序。
• 律师可以帮助公司分析项目专用账户资金的性质、来源和用途，评估执行风险，并提供相应的法律策略和建议。
• 公司也可以积极与法院沟通，提供相关证据和材料，以证明项目专用账户资金的特殊性和必要性，从而争取法院的理解和支持。

可能后果：

• 如果项目专用账户的资金被执行，可能会导致公司项目进展受阻、经营困难甚至破产等严重后果。
• 因此，公司应高度重视执行案件对项目专用账户资金的影响，并采取积极措施加以应对和防范。

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