结论是：电子合同涉及几千元的纠纷，完全可以起诉。下面我从几个角度为你详细解释：
一、法律层面
合同效力：电子合同与纸质合同在法律上具有同等的效力。只要电子合同符合《中华人民共和国民法典》中关于合同成立和生效的要件，即双方意思表示真实、内容合法、不违反公序良俗等，那么该电子合同就是有效的，受法律保护。因此，无论合同金额大小，只要存在纠纷，都可以通过法律途径解决。
起诉条件：根据《中华人民共和国民事诉讼法》的规定，起诉的条件主要包括原告与本案有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由、属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。在电子合同纠纷中，只要你能够提供充分的证据证明合同的存在、履行情况以及对方的违约行为等，就可以满足起诉的条件。
二、实际操作层面
诉讼成本：虽然几千元的纠纷金额不大，但诉讼成本（如诉讼费、律师费等）是需要考虑的因素。不过，诉讼费通常是根据纠纷金额来计算的，几千元的纠纷诉讼费相对较低。而且，如果你选择自己起诉，不聘请律师，那么律师费就可以省去。当然，如果案件复杂或你对法律程序不熟悉，聘请律师可能会更有助于你维护自己的权益。
证据收集：在电子合同纠纷中，证据的收集尤为重要。你需要保存好电子合同的原文、交易记录、聊天记录等能够证明合同存在和履行情况的证据。这些证据在起诉时将起到关键作用。
诉讼流程：起诉电子合同纠纷的流程与起诉其他类型的合同纠纷类似。你需要准备好起诉状和相关证据材料，向有管辖权的人民法院提起诉讼。法院在受理案件后，会安排开庭审理，并根据事实和法律作出判决。
三、建议与提醒
尝试协商：在起诉之前，你可以先尝试与对方进行协商，看是否能够达成和解协议。这样既可以节省时间和精力，又可以避免不必要的诉讼成本。
咨询专业人士：如果你对法律程序不熟悉或案件比较复杂，建议咨询专业律师的意见。律师可以根据你的具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。
注意诉讼时效：根据《中华人民共和国民法典》的规定，民事纠纷的诉讼时效通常为三年。因此，在发现对方违约或存在其他纠纷时，要及时采取措施维护自己的权益，避免超过诉讼时效而丧失胜诉权。
如果你在电子合同纠纷方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。