总公司向项目部借款，在符合法律法规和公司章程规定的情况下是合法的。以下从多个角度对此问题进行分析：
一、法律层面
公司法相关规定：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关法律法规，公司内部之间的资金往来，包括总公司与项目部之间的借款，并未被明确禁止。但关键在于这种借款行为是否遵循了公司章程的规定，以及是否履行了必要的内部决策程序（如董事会或股东会的决议）。
合同自由原则：
- 借款行为本质上是一种合同关系，受《中华人民共和国民法典》合同编的调整。只要双方意思表示真实，不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，该借款合同就是有效的。
二、公司章程与内部管理
公司章程的约束：
- 公司章程是公司的“宪法”，对公司及其股东、董事、监事、高级管理人员等具有约束力。如果公司章程中明确规定了总公司与项目部之间的资金往来程序、审批权限等，那么借款行为必须遵循这些规定。
内部管理规范：
- 除了公司章程外，公司还可能制定有内部管理规范或财务制度，对资金往来进行进一步规范。借款行为也应符合这些内部管理规范的要求。
三、实际操作建议
完善借款手续：
- 总公司与项目部之间的借款，应签订书面借款合同，明确借款金额、期限、利率、还款方式等关键条款。同时，应保留好借款发放和回收的凭证，如银行转账记录、收据等。
履行内部决策程序：
- 根据公司章程和内部管理规范的要求，履行必要的内部决策程序，如董事会或股东会的决议。这有助于确保借款行为的合法性和合规性，避免后续产生纠纷。
关注税务合规：
- 借款行为可能涉及税务问题，如利息收入的税务处理等。因此，在借款过程中，应关注税务合规问题，确保按照税法规定进行申报和缴纳税款。
四、潜在法律风险
关联交易风险：
- 如果总公司与项目部之间的借款行为被认定为关联交易，且未按照相关规定进行披露和审批，可能面临监管机构的处罚和股东的诉讼风险。
资金挪用风险：
- 如果借款资金被挪用于非项目用途，可能构成资金挪用，违反公司章程和内部管理规范，甚至可能触犯刑法中的挪用资金罪等。
总结与建议：总公司向项目部借款在符合法律法规和公司章程规定的情况下是合法的。但为了确保借款行为的合法性和合规性，避免潜在的法律风险，建议公司在借款过程中完善借款手续、履行内部决策程序、关注税务合规问题，并加强资金监管，确保借款资金用于项目用途。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。