结论：公司欠款一般不能直接找上游投资99%股权的企业要求偿还，但存在特定情形时，可向该企业主张权利。以下从不同角度进行分析：
一、公司独立责任原则
- 法律基础：根据《中华人民共和国公司法》第三条，公司是企业法人，拥有独立的法人财产，并以其全部财产对公司的债务承担责任。这表明公司作为独立的法律主体，其债务应由公司自身承担，与股东（包括上游投资企业）无直接关联。
- 应用分析：在一般情况下，若公司欠款，债权人应直接向公司主张债权，而不能直接要求上游投资企业偿还。上游投资企业作为股东，仅以其认缴的出资额或认购的股份为限对公司承担责任。
二、股东滥用权利时的连带责任
- 法律基础：根据《中华人民共和国公司法》第二十条，若公司股东滥用公司法人独立地位和股东有限责任，逃避债务，严重损害公司债权人利益的，应当对公司债务承担连带责任。
- 应用分析：
- 特定情形：若上游投资企业作为股东，存在滥用权利、逃避债务的行为，如抽逃出资、转移财产等，导致公司无法偿还债务，严重损害债权人利益的，债权人可要求该企业对公司债务承担连带责任。
- 举证责任：债权人需承担举证责任，证明上游投资企业存在滥用权利的行为，以及该行为与公司无法偿还债务之间存在因果关系。
三、实际控制人或关联交易的影响
- 法律考量：若上游投资企业作为公司的实际控制人，或通过关联交易等方式影响公司的经营和财务状况，导致公司无法偿还债务的，债权人可考虑从实际控制人责任或关联交易的角度主张权利。
- 应用分析：
- 实际控制人责任：根据相关法律规定，实际控制人若利用其控制地位损害公司或债权人利益的，应承担相应的赔偿责任。
- 关联交易：若上游投资企业与公司之间存在不公平的关联交易，导致公司财产减少、债务增加的，债权人可要求撤销该交易或主张损害赔偿。
四、建议与风险提示
- 建议：
- 收集证据：若债权人认为上游投资企业应承担公司债务的偿还责任，应收集相关证据，如公司财务状况、股东出资情况、关联交易记录等。
- 咨询专业律师：在主张权利前，建议咨询专业律师，了解具体法律程序和策略，以提高胜诉率。
- 风险提示：
- 举证难度：主张上游投资企业承担连带责任或实际控制人责任时，举证难度较大，需充分准备证据。
- 法律程序：涉及公司债务和股东责任的案件，法律程序可能较为复杂，需耐心应对。
总结：公司欠款一般不能直接找上游投资99%股权的企业要求偿还，但在特定情形下，如股东滥用权利、实际控制人责任或关联交易等，债权人可向该企业主张权利。在主张权利前，建议收集相关证据并咨询专业律师。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。