结论：总公司中标后让分公司实施项目，一般情况下分公司不能直接以自己的名称签署合同，但在特定条件下，如获得招标人同意或总公司特别授权的情况下，分公司签署合同可能具有合法性。以下是对此问题的详细分析：
一、一般情况下的法律限制
招投标活动的公平性原则：
- 招投标活动必须遵循公平、公正、公开的原则。分公司作为独立的经营实体（尽管不具有独立法人资格），在招投标过程中是以其自身的资质、能力、业绩等条件参与竞争的。若中标后由分公司以外的主体（如总公司）签署合同，将违背招投标的基本规则，损害其他投标人的合法权益，破坏市场竞争的公平性。
合同主体的合法性：
- 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，中标后签订合同的主体应与投标主体保持一致。分公司中标后，原则上应由分公司签署合同，以确保合同主体的合法性和一致性。
法律责任的明确性：
- 分公司不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担。若允许分公司随意签署合同，可能导致合同主体与责任主体不一致，进而引发责任不清、权利义务不明等问题，影响招标方的合法权益和招投标活动的正常秩序。
二、特定条件下的合法性探讨
招标人同意：
- 如果招标人在招投标文件中明确规定或事先说明允许中标人可以由其分公司签署合同，并且在实际操作中获得了招标人的明确同意或认可，那么分公司签署合同可能具有合法性。这种情况下，招标人对合同签署主体的变更表示了认可，视为对招投标程序的一种特殊安排。
总公司特别授权：
- 如果分公司获得总公司的特别授权，明确授权分公司就该中标项目签署合同，并且这种授权得到了招标人的充分披露和认可，那么分公司签署合同也有可能得到有效处理。此时，分公司作为总公司的代理人，在授权范围内签署合同，法律后果由总公司承担。
三、实际操作中的建议
优先由总公司签署合同：
- 为确保合同的合法性和有效性，避免潜在的法律风险和问题，建议在实际操作中优先考虑由总公司直接签署合同。这样可以确保合同主体与投标主体一致，符合招投标活动的公平性原则和合同主体的合法性要求。
明确授权和披露：
- 若确需由分公司签署合同，应确保已获得总公司的明确授权，并向招标人及相关方充分披露该授权情况。授权文件应真实有效，授权范围清晰明确，以避免后续纠纷和责任不清的问题。
咨询专业法律意见：
- 在涉及复杂法律问题的招投标活动中，建议及时咨询专业法律意见。作为白金城的专业律师，我可以根据具体的项目情况、地区法律法规以及合同条款，为你提供针对性的法律建议和解决方案。
总结：总公司中标后让分公司实施项目时，分公司一般不能直接以自己的名称签署合同。但在特定条件下，如获得招标人同意或总公司特别授权的情况下，分公司签署合同可能具有合法性。为确保操作的合规性和有效性，建议在实际操作前充分考虑各种因素，并咨询专业法律意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。