在农业用地上建设养殖设施是否合法，需根据具体情况综合判断，并非一概而论。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
一、农用地类型与养殖设施建设的合法性
耕地：
- 永久基本农田：法律明确禁止占用永久基本农田进行非农建设，包括搭建养殖场。因此，在永久基本农田上建设养殖设施通常被视为违建。
- 普通耕地：若养殖场建设不涉及将农用地转为建设用地，且符合相关法律法规和规划（如乡（镇）土地利用总体规划），并办理了相关备案和审批手续，则可能不属于违建。但需注意，即使如此，也需确保符合环保要求，避免对环境造成污染。
非耕地农用地（如林地、草地、养殖水面等）：
- 在这些类型的农用地上搭建养殖设施，若符合乡（镇）土地利用总体规划，并办理了相关备案和审批手续，通常不属于违建。
- 对于修建永久性结构的养殖设施，还需确保符合环保要求，并办理农用地转用审批手续，以符合土地管理法规的规定。
二、合法性条件与手续
为确保养殖设施的合法性，需满足以下条件并办理相关手续：
- 取得合法承包经营权证：依据《民法典》规定，土地承包经营权人依法对其承包经营的土地享有占有、使用和收益的权利。因此，建设养殖场前需确保已取得合法的土地承包经营权证。
- 符合乡（镇）土地利用总体规划：根据相关法律法规，乡（镇）土地利用总体规划应安排畜禽养殖用地。建设养殖场需符合该规划，以确保土地使用的合规性。
- 办理备案和审批手续：可能需向国土部门、农业部门、环保部门等办理养殖设施的备案和审批手续，包括但不限于养殖设施用地备案、环评审批、动物防疫条件合格证等。这些手续是确保养殖设施合法性的重要环节。
三、可能被认定为违建的情况
- 未经审批擅自建设：未按照规定向相关部门申请，或申请未获批准就自行开工建设养殖设施，将被视为违建。这可能导致养殖设施被责令拆除或面临罚款等法律后果。
- 改变土地用途：将原本用于养殖的农用地改变为其他非农建设用途，如建设永久性住宅、商业设施等，将违反土地管理法规，所建设施会被认定为违建。
- 超出规定的用地规模：各地对养殖设施用地规模有明确的标准限制。若养殖者建设的养殖设施用地面积超出了当地规定的范围，超出部分的设施可能被认定为违建。
- 禁止建设养殖场的区域：在饮用水水源保护区、风景名胜区、自然保护区的核心区和缓冲区、城镇居民区等人口集中区域建设养殖场是违法的，无论农用地类型如何。这些区域对环境保护和居民生活有特殊要求，因此禁止建设养殖场。
四、实际操作建议
- 核实土地性质：在决定建设养殖场前，务必核实土地性质，确保非基本农田。这是避免违建风险的第一步。
- 咨询当地部门：咨询当地自然资源、农业农村等部门，了解具体政策要求和审批流程。不同地区的政策可能存在差异，因此需根据当地实际情况进行操作。
- 严格遵守环保要求：养殖场建设和运营需符合环保标准，配备污染防治设施，防止环境污染。这是确保养殖场合法运营的重要环节。
- 保留好审批文件：保留好所有审批文件和相关证据，以备不时之需。在面临检查或纠纷时，这些文件将作为证明养殖场合法性的重要依据。
总结来说，农业用地上建设养殖设施的合法性取决于多个因素，包括农用地类型、建设行为的合规性、相关手续的办理情况以及特定区域的限制等。在决定建设前，建议充分了解相关法律法规和政策要求，并咨询当地相关部门或我（范博翔律师，专注于刑事辩护、取保候审、建设工程、交通事故、房产纠纷、招商引资、投资融资领域）以获取专业指导，以确保建设行为的合规性。