在医疗责任纠纷中，法院将被告未经质证的补充材料交给鉴定机构，这一行为通常是不合法的。以下从几个角度详细分析：

1. 质证程序的重要性：

   • 质证是诉讼程序中的关键环节，它确保了双方当事人有机会对对方提交的证据进行审查、质疑和辩论，从而保障审判的公正性和透明度。
   • 未经质证的证据，其真实性、合法性和关联性均未得到双方当事人的确认，直接将其作为鉴定依据，可能损害当事人的合法权益，特别是被告方的抗辩权。

2. 法院行为的合法性分析：

   • 根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，法院在审理案件时，必须遵循法定程序，包括质证程序。将未经质证的证据直接交给鉴定机构，违反了法定程序，可能构成程序违法。
   • 鉴定机构作为第三方专业机构，其鉴定意见在诉讼中往往具有重要影响力。如果鉴定依据未经质证，那么鉴定意见的公正性和准确性也可能受到质疑。

3. 可能的法律后果：

   • 如果法院确实将未经质证的补充材料交给了鉴定机构，并且该鉴定意见被采纳作为判决依据，那么被告方有权提出异议，并可能以此为由申请再审或上诉。
   • 在极端情况下，如果程序违法严重影响了案件的公正审理，上级法院可能会撤销原判决，发回重审或直接改判。

4. 建议与应对措施：

   • 对于被告方而言，如果发现法院将未经质证的补充材料交给了鉴定机构，应立即向法院提出书面异议，要求法院重新组织质证或排除该未经质证的证据。
   • 同时，被告方也可以考虑在上诉或再审程序中以此为由提出抗辩，以维护自己的合法权益。

总结来说，法院在医疗责任纠纷中将被告未经质证的补充材料交给鉴定机构，这一行为通常是不合法的，可能构成程序违法。被告方应积极行使自己的诉讼权利，对未经质证的证据提出异议，并在必要时寻求法律救济。如果你在医疗责任纠纷中遇到了类似问题，或者有其他相关疑问，可以直接向我咨询。