结论：公司内设机构对外签订合同，合同的权利义务原则上应当由公司承担，但具体是否承担以及承担方式需根据内设机构是否具有独立法人资格、是否获得公司授权等因素综合判断。以下从不同角度进行详细分析：

1. 内设机构不具有独立法人资格的情况

   • 法律背景：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法人可以依法设立分支机构。分支机构以自己的名义从事民事活动，产生的民事责任由法人承担；也可以先以该分支机构管理的财产承担，不足以承担的，由法人承担。公司内设机构，如部门、项目组等，通常不具有独立法人资格，其对外签订合同的行为应视为公司的行为。
   • 法律建议：在此情况下，合同的权利义务应由公司承担。若内设机构在签订合同时未获得公司明确授权，但相对方有理由相信其有代理权（如表见代理情形），公司仍可能需承担合同责任。因此，公司应加强对内设机构的管理，明确授权范围，避免不必要的法律风险。
   • 可能后果：若公司拒绝承担合同责任，相对方有权依据合同约定及法律规定，向公司主张权利，包括要求履行合同、赔偿损失等。

2. 内设机构具有独立法人资格或获得公司明确授权的情况

   • 法律背景：若公司内设机构具有独立法人资格（如子公司），或虽不具有独立法人资格但获得了公司的明确授权（如分公司经授权签订特定合同），则该内设机构在授权范围内对外签订的合同，其权利义务可由该内设机构自行承担，或根据授权协议由公司承担部分或全部责任。
   • 法律建议：在此情况下，公司应与内设机构明确授权范围、责任承担方式等，并在合同中予以体现。同时，公司应加强对内设机构的监督和管理，确保其依法依规签订合同，避免损害公司利益。
   • 可能后果：若内设机构在授权范围内签订合同并履行义务，则合同权利义务由内设机构或公司（根据授权协议）承担；若内设机构超出授权范围签订合同或未履行义务，则可能由内设机构自行承担责任，公司也可能因管理不善而承担连带责任。

3. 特殊情况下的责任承担

   • 表见代理：若内设机构在签订合同时未获得公司明确授权，但相对方有理由相信其有代理权（如内设机构持有公司公章、合同书等），且相对方善意无过失，则可能构成表见代理。在此情况下，公司仍需承担合同责任。
   • 职务行为：若内设机构的工作人员在执行职务过程中签订合同，且该行为属于职务行为范畴，则合同的权利义务应由公司承担。但若工作人员超出职务范围或违反公司规定签订合同，则可能由工作人员个人承担责任或公司承担部分责任后向工作人员追偿。

进一步思考：公司在日常经营中应加强对内设机构的管理和监督，明确授权范围和责任承担方式。同时，公司应建立健全合同管理制度，规范合同签订、履行、变更、解除等流程，降低法律风险。若遇到具体法律问题或纠纷，建议及时咨询专业律师以获取针对性法律建议。