作为社区工作人员，关于您妹妹没有民事行为能力，社区是否可以指定监护人的问题，我可以给您详细解答。
首先，根据《民法典》的相关规定，对于无民事行为能力或者限制民事行为能力的成年人，其监护人的指定是有明确顺序和条件的。在您妹妹的情况下，如果她的父母已经去世或者没有监护能力，且她没有子女，那么接下来会考虑其他近亲属是否有监护能力。若其他近亲属也无法担任监护人，或者没有其他近亲属，那么就需要考虑由其他愿意担任监护人的个人或者组织来担任。
关键点在于，如果其他个人或组织愿意担任监护人，必须经过被监护人住所地的居民委员会（即您所在的社区）、村民委员会或者民政部门的同意。这意味着，社区在监护人指定过程中扮演着重要的审核和同意角色，但社区本身并不能直接“指定”监护人，而是对愿意担任监护人的个人或组织进行审核，并决定是否同意其担任。
特殊情况，如果像您提到的案例中那样，被监护人没有依法具有监护资格的近亲属，且面临监护困境，社区可以在法院的引导和协调下，主动申请担任公职监护人。这种情况下，社区会承担兜底性的监护职责，确保被监护人的生活和医疗需求得到满足。但这通常需要法院的介入和判决，社区不能自行决定。
建议步骤：
调查了解：首先，社区可以进一步了解您妹妹的具体情况，包括她的财产状况、日常生活需求等，以便为后续的监护安排做好准备。
寻找合适监护人：尝试寻找您妹妹的其他近亲属或者愿意担任监护人的个人或组织，并与其沟通协商。
审核与同意：如果有个人或组织愿意担任监护人，社区需要对其进行审核，确保其具备监护能力，并决定是否同意其担任。
法院介入（如需）：如果面临监护困境，无法找到合适的监护人，社区可以与法院沟通，申请担任公职监护人，并按照法院的判决和指导履行监护职责。
综上所述，社区在监护人指定过程中扮演着重要的角色，但并不能直接指定监护人。社区需要根据《民法典》的相关规定和实际情况，积极寻找合适的监护人，并在必要时与法院沟通协调，确保被监护人的权益得到保障。