农村土地转让协议一式两份都是单方签字不合法，该协议未成立，不产生法律效力。具体分析如下：

1. 合同成立的基本要件：根据《中华人民共和国民法典》第四百九十条，当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在农村土地转让协议中，若仅有一方签字，而另一方未签字，则该协议因缺乏双方合意而未成立。

2. 单方签字的法律后果：

   • 协议未成立：由于另一方未签字，表明其未对协议内容表示认可，因此协议未成立。未成立的协议对双方均无法律约束力。
   • 无权处分风险：若单方签字的协议涉及土地转让，而签字方并非土地的所有权人或合法使用权人，则该协议可能因无权处分而无效。即使签字方是土地的所有权人或合法使用权人，由于另一方未签字，协议仍未成立，无法产生法律效力。

3. 实际操作建议：

   • 确保双方签字：在签订农村土地转让协议时，务必确保双方均在协议上签字、盖章或按指印，以表明双方对协议内容的认可。
   • 审查主体资格：在签订协议前，应审查对方的主体资格，确保其具有签订协议的合法身份和权限。
   • 明确协议内容：协议内容应明确、具体，包括土地的位置、面积、转让价格、付款方式、违约责任等条款，以避免因协议内容不明确而产生纠纷。

4. 特殊情况说明：

   • 追认情况：如果单方签字的协议在事后得到另一方的追认（即另一方事后签字或以其他方式表示认可），则该协议可能因追认而成立并产生法律效力。但这种情况较为特殊，且需要明确的证据支持。
   • 表见代理情况：如果单方签字的协议涉及表见代理（即签字方以另一方的名义签订协议，且另一方在客观上具有使签字方相信其有代理权的理由），则该协议可能因表见代理而成立并产生法律效力。但这种情况同样需要明确的证据支持，且较为复杂。