专利代理分所负责人的社保缴纳地点，需根据分所的独立法人资格及双方约定综合判断，具体如下：

1. 若分所具有独立法人资格
   根据《社会保险法》及《劳动合同法》，分所作为独立用工主体，应独立承担社保缴纳义务。此时分所负责人若与分所签订劳动合同，社保应在分所所在地缴纳，与总所无关。
   法律依据：

   • 《社会保险法》第57条：用人单位应当自成立之日起30日内办理社保登记。
     
   • 《劳动合同法》第2条：中华人民共和国境内的企业、个体经济组织等与劳动者建立劳动关系，适用本法。

2. 若分所不具有独立法人资格（仅为分支机构）
   此时分所的民事责任由总所承担，社保缴纳需分情况处理：

   • 情况一：若负责人与总所签订劳动合同并被派驻分所工作，社保应在总所所在地缴纳，但分所可能需承担部分费用（如补充医保等）。
     
   • 情况二：若负责人与分所实际签订劳动合同（即使分所无独立法人资格），部分地区社保部门可能允许以分所名义缴纳，但需总所出具授权或担保文件。
     实践提示：
     需结合当地社保政策（如北京、上海要求分支机构需有独立营业执照方可缴纳社保）及劳动合同签订主体综合判断。

3. 特殊情形：跨地区派遣
   若负责人被总所派驻分所工作且劳动合同与总所签订，根据《劳务派遣暂行规定》，总所需在用工单位所在地（分所所在地）为被派遣劳动者参加工伤保险，其他险种仍由总所缴纳。
   例外：若分所所在地社保政策要求所有险种必须在当地缴纳，则需按当地规定执行。

建议操作步骤：

1. 核查分所营业执照类型（是否标注“独立法人”）；
   
2. 审查负责人劳动合同签订主体；
   
3. 咨询分所所在地社保部门关于分支机构参保的具体要求；
   
4. 若涉及跨地区派遣，需同时符合总所和分所所在地政策。
   

如有进一步细节（如分所注册地、劳动合同签订情况等），可补充说明后为您深入分析。