如果代理所分所的负责人不是专利代理人，可能会面临以下几种情况和影响：
合规性风险：
- 根据相关法律法规及行业规范，专利代理机构的负责人通常需要具备专利代理人资格，以确保其具备处理专利事务的专业能力和法律素养。如果分所负责人不是专利代理人，可能违反了相关法规或行业规范，从而面临合规性风险。这种风险可能导致代理所受到监管机构的处罚，如警告、罚款、甚至吊销执业许可等。
业务运营影响：
- 专利代理业务涉及复杂的法律和技术问题，需要负责人具备深厚的专业知识和丰富的实践经验。如果分所负责人不是专利代理人，可能缺乏处理这些事务的能力，从而影响代理所的业务运营和客户满意度。例如，在处理专利申请、无效宣告、侵权诉讼等事务时，非专利代理人的负责人可能无法准确判断案件走向，给出恰当的法律建议，导致客户利益受损。
内部管理挑战：
- 专利代理机构通常需要建立一套完善的内部管理制度，以确保业务操作的规范性和效率性。如果分所负责人不是专利代理人，可能难以理解和执行这些制度，导致内部管理混乱。例如，在案件分配、进度跟踪、质量控制等方面，非专利代理人的负责人可能无法有效协调和管理，影响代理所的整体运营效率。
法律责任风险：
- 在专利代理业务中，负责人通常需要对代理所的业务活动承担法律责任。如果分所负责人不是专利代理人，可能因缺乏专业知识和经验而无法准确判断业务活动的合法性，从而增加法律责任风险。例如，在签署代理合同、出具法律意见书等文件中，非专利代理人的负责人可能因疏忽或无知而违反法律规定，导致代理所承担不必要的法律责任。
建议与措施：
- 合规性建议：代理所应确保分所负责人具备专利代理人资格，或至少具备足够的法律和技术知识，以符合相关法规和行业规范的要求。同时，代理所应定期对负责人进行培训和考核，确保其具备处理专利事务的能力。
- 业务运营建议：代理所应建立完善的业务运营流程和管理制度，确保分所负责人在处理专利事务时能够遵循规范、提高效率。同时，代理所可以设立专门的业务指导团队或咨询机制，为分所负责人提供必要的支持和帮助。
- 内部管理建议：代理所应加强内部管理，建立有效的沟通机制和协调机制，确保分所负责人能够与其他部门或人员有效协作、共同推进业务发展。同时，代理所可以定期对内部管理进行评估和改进，以提高整体运营效率和管理水平。
- 法律责任防范：代理所应加强对分所负责人的法律教育和培训，提高其法律意识和风险防范能力。同时，代理所可以建立法律责任防范机制，如设立法律顾问团队、购买责任保险等，以降低法律责任风险。
总结来说，代理所分所的负责人如果不是专利代理人，可能会面临合规性风险、业务运营影响、内部管理挑战以及法律责任风险等多方面的问题。因此，代理所应采取相应措施确保分所负责人具备足够的专业能力和法律素养，以推动代理所的健康发展。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。