水质采样器超标留样在符合法定条件的情况下，是可以作为处罚依据的。以下从多个角度为你详细分析：
一、法律依据与留样要求
根据《中华人民共和国行政处罚法》及相关环保法规，行政机关在查处环境违法行为时，需要确保所依据的证据合法、有效。水质采样器超标留样，作为环境监测数据的一种，其合法性主要取决于采样过程是否符合法定程序和标准。具体来说，采样应当由具有相应资质的人员进行，采样方法、采样容器、保存条件等均需符合相关技术规范，以确保留样能够真实反映水质状况。
二、留样作为处罚依据的条件
- 采样过程合法：采样必须由具备资质的环境监测机构或人员按照法定程序进行，确保采样的代表性和准确性。
- 留样保存完好：留样在保存过程中需符合相关标准，防止污染或变质，以确保留样在后续检测中的有效性。
- 检测结果可靠：留样需送至具备相应资质的检测机构进行检测，检测结果需准确可靠，能够作为处罚的依据。
三、实际应用中的注意事项
- 证据链的完整性：在处罚过程中，除了水质采样器超标留样外，还需结合其他证据，如现场检查记录、监测报告、当事人陈述等，形成完整的证据链，以证明违法事实的存在。
- 当事人的权利保障：在处罚过程中，应保障当事人的合法权益，如告知当事人有权对留样进行复检、有权提出陈述和申辩等。
- 处罚的合法性与合理性：处罚决定需基于合法、有效的证据，且处罚幅度需符合相关法律法规的规定，确保处罚的合法性与合理性。
四、可能遇到的法律问题及应对
- 留样被质疑：如果当事人对留样的合法性或检测结果提出质疑，行政机关需提供充分的证据证明采样过程的合法性和检测结果的可靠性。
- 证据不足：如果留样作为唯一证据时存在瑕疵或不足，行政机关需结合其他证据进行综合判断，或补充调查以完善证据链。
建议：在实际操作中，为确保水质采样器超标留样能够作为有效的处罚依据，建议行政机关在采样、保存、检测等各个环节均严格遵守法定程序和标准，并妥善保存相关证据材料。如果遇到复杂的法律问题或需要进一步的法律指导，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律意见。