检察院在自侦案件中，通常会在以下几种情况下做出不起诉决定：

1. 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的：

   • 如果检察院认为犯罪嫌疑人的行为虽然违法，但情节显著轻微，对社会造成的危害不大，根据刑法的规定，不构成犯罪，因此会做出不起诉决定。例如，某些轻微的违法行为，虽然触犯了法律，但并未达到犯罪的程度，检察院会依法不予起诉。

2. 犯罪已过追诉时效期限的：

   • 根据刑法的规定，犯罪有一定的追诉时效期限。如果犯罪行为已经超过了法定的追诉时效期限，检察院将不再追究犯罪嫌疑人的刑事责任，因此会做出不起诉决定。这是法律对犯罪行为追诉时效的一种限制，旨在保护犯罪嫌疑人的合法权益，避免无限期地追究其刑事责任。

3. 经特赦令免除刑罚的：

   • 如果犯罪嫌疑人获得了国家的特赦令，即被免除了刑罚，那么检察院将不再对其提起公诉。特赦是国家对特定犯罪嫌疑人的一种宽大处理，体现了国家的仁慈和宽容。

4. 依照刑法告诉才处理的犯罪，没有告诉或者撤回告诉的：

   • 有些犯罪行为，根据刑法的规定，需要被害人告诉才处理。如果被害人没有告诉或者撤回告诉，检察院将不再追究犯罪嫌疑人的刑事责任。这是法律对被害人自主处分权的一种尊重，也是保护被害人合法权益的一种体现。

5. 犯罪嫌疑人、被告人死亡的：

   • 如果犯罪嫌疑人或被告人在案件侦查、审查起诉或审判过程中死亡，那么检察院将不再对其提起公诉。因为刑事诉讼的目的是对犯罪嫌疑人或被告人进行刑事处罚，而死亡的人已经无法接受刑事处罚，因此检察院会做出不起诉决定。

6. 其他法律规定免予追究刑事责任的：

   • 除了上述几种情况外，如果法律另有规定免予追究犯罪嫌疑人刑事责任的，检察院也会根据法律规定做出不起诉决定。这是法律对特定情况的一种特殊规定，旨在保护犯罪嫌疑人的合法权益或维护社会的公共利益。

在做出不起诉决定时，检察院会综合考虑案件的具体情况、犯罪嫌疑人的个人情况以及社会的公共利益等因素。例如，如果犯罪嫌疑人具有自首、立功、认罪认罚等情节，或者案件的社会影响较小，检察院可能会倾向于做出不起诉决定。同时，检察院也会听取犯罪嫌疑人、被害人及其家属的意见，确保决定的公正性和合理性。

如果您对检察院自侦案件的不起诉决定有疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。我会根据您的具体情况，提供专业的法律意见和帮助。