关于您提出的“留置三个月了，监委申请延期由什么理由批准”的问题，这涉及到监察法中关于留置措施期限及延长的具体规定。

首先，根据《中华人民共和国监察法》的相关规定，留置时间一般不得超过三个月。这是留置措施的固定期限，不因案件情况的变化而变化，也不能因为发现新的职务违法犯罪行为而重新计算留置期限。

然而，在特殊情况下，留置期限是可以延长一次的，但延长的时间也不得超过三个月。这里的“特殊情况”通常指的是案件复杂、涉及面广、取证困难等确实需要更多时间进行调查的情形。这些情形需要由监察机关根据案件的具体情况，经过集体研究决定，并报上一级监察机关批准后，才能延长留置期限。

对于省级以下（含省级）的监察机关来说，如果需要延长留置期限，除了要经过本机关领导人员的集体研究决定外，还必须报上一级监察机关批准。这是为了强化对留置措施的程序制约，防止监察机关滥用留置措施。

在实际操作中，监察机关在申请延长留置期限时，会详细说明案件的情况、调查的进展、需要延长留置期限的具体理由等，以便上一级监察机关进行审批。上一级监察机关在审批时，会综合考虑案件的复杂性、调查的必要性、留置期限的合理性等因素，作出是否批准的决定。

因此，如果监委申请延长留置期限，必须基于案件确实存在特殊情况，且经过集体研究决定，并报上一级监察机关批准后，才能实施。这是为了保障被调查人的合法权益，同时确保监察机关能够依法、有效地开展调查工作。