结论是，盗版小说网站即使获利很少，也有可能留下案底，具体取决于多种因素，包括违法行为的性质、情节严重程度以及是否受到刑事处罚等。以下从不同角度为你详细分析：

一、违法行为的性质

盗版小说网站的行为通常涉及侵犯著作权，这是一种违法行为。根据《中华人民共和国著作权法》的相关规定，未经著作权人许可，复制、发行、表演、放映、广播、汇编、通过信息网络向公众传播其作品的，均构成侵权。因此，盗版小说网站的行为从性质上来说就是违法的，无论其获利多少。

二、情节严重程度

虽然获利多少是衡量违法行为情节严重程度的一个因素，但并非唯一因素。法院在判决时，会综合考虑多种因素，包括侵权行为的持续时间、侵权作品的数量、对著作权人造成的损失、侵权人的主观恶意等。因此，即使盗版小说网站获利很少，但如果其侵权行为情节严重，如长期大量传播盗版作品，对著作权人造成了较大损失，或者侵权人具有明显的主观恶意，那么仍然有可能受到较重的处罚，包括留下案底。

三、是否受到刑事处罚

1. 行政处罚与刑事处罚的区别：

   • 行政处罚：通常针对违法行为情节较轻的情况，由行政机关依法作出，如罚款、没收违法所得、责令停止侵权行为等。行政处罚不会留下案底，但会记录在行政处罚记录中。
   • 刑事处罚：针对违法行为情节严重，构成犯罪的情况，由法院依法作出，如有期徒刑、拘役、罚金等。刑事处罚会留下案底，即犯罪记录，对个人的社会信用和未来发展产生较大影响。

2. 盗版小说网站可能面临的刑事处罚：

   • 如果盗版小说网站的行为构成犯罪，如侵犯著作权罪，那么其经营者或相关责任人员可能会受到刑事处罚，从而留下案底。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，以营利为目的，未经著作权人许可，复制发行其文字作品、音乐、电影、电视、录像作品、计算机软件及法律、行政法规规定的其他作品的，违法所得数额较大或者有其他严重情节的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金；违法所得数额巨大或者有其他特别严重情节的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

四、实际案例与法律实践

在实际的法律实践中，法院会根据具体案件的情况，综合考虑上述因素，作出公正的判决。因此，即使盗版小说网站获利很少，但如果其侵权行为情节严重，或者构成了犯罪，那么仍然有可能受到刑事处罚，留下案底。

五、建议与措施

1. 遵守法律法规：作为网站经营者或相关责任人员，应严格遵守著作权法等相关法律法规，不传播盗版作品，尊重他人的知识产权。
2. 加强自我保护：著作权人应加强自我保护意识，及时对侵权行为进行维权，通过法律手段维护自己的合法权益。
3. 寻求法律帮助：如果你或你的企业涉及盗版小说网站的相关问题，或者需要了解更多关于著作权保护的法律知识，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。

综上所述，盗版小说网站即使获利很少，也有可能留下案底，具体取决于违法行为的性质、情节严重程度以及是否受到刑事处罚等多种因素。因此，建议网站经营者或相关责任人员严格遵守法律法规，避免涉及盗版等违法行为。