扣押货物损失的计算需根据货物性质、损失原因及责任归属综合判定，具体分为以下几种情形：

1. 因行政机关违法扣押导致的损失
   根据《国家赔偿法》第三十六条，若行政机关违法扣押货物造成直接损失（如货物贬值、变质、灭失等），赔偿范围以实际损失为限。例如：

   • 鲜活易腐货物因扣押延误导致腐烂，按市场价扣除合理残值后赔偿；
     
   • 工业原料因扣押错过生产周期导致合同违约，仅赔偿原料本身价值，不赔偿间接利润损失。
     关键点：需证明扣押行为违法（如超期扣押、无合法依据），且损失与扣押行为存在直接因果关系。

2. 因司法机关保全错误导致的损失
   根据《民事诉讼法》第一百零八条，申请保全错误需赔偿被保全人损失。计算方式包括：

   • 货物贬值损失：如扣押期间市场价格下跌，按差价赔偿；
     
   • 仓储费用：若扣押导致额外仓储支出，需赔偿合理费用；
     
   • 经营损失：仅限“直接必然损失”，如因扣押无法履行合同导致的违约金（需证明必然性）。
     例外：若保全申请人提供充分担保，可能减轻赔偿责任。

3. 因第三人侵权导致的扣押货物损失
   若扣押系第三人非法行为（如盗窃、抢夺），按《民法典》侵权责任编计算损失：

   • 恢复原状：能修复的货物（如设备损坏），赔偿修复费用；
     
   • 折价赔偿：无法修复的货物（如消耗品），按市场价赔偿；
     
   • 特殊价值：如货物具有纪念意义或稀缺性，可主张精神损害赔偿（需法院认定）。
     注意：需举证侵权行为与损失的关联性（如监控录像、鉴定报告）。

4. 因不可抗力或货物自身原因导致的损失
   若损失由自然灾害、货物固有缺陷等不可归责因素导致，通常无需赔偿。但需满足：

   • 扣押程序合法（如符合法定期限、条件）；
     
   • 已尽合理保管义务（如按货物特性存储）。
     示例：合法扣押的化学品因暴雨泄漏，若已采取防潮措施，则不承担赔偿责任。

操作建议：

1. 立即固定证据（如扣押清单、损失照片、市场价证明）；
   
2. 区分损失类型（直接/间接、违法/合法扣押）；
   
3. 优先通过协商或行政赔偿程序解决，必要时提起民事诉讼。
   

如有具体案件细节（如扣押主体、货物类型、损失原因），可进一步分析责任比例和赔偿范围。