结论：在建设工程合同中设置了预付款，并不意味着就必须要有预付款担保，这主要取决于合同双方的约定以及相关法律法规和行业惯例的要求。
法律分析：
合同约定优先：
- 建设工程合同是双方自愿达成的协议，合同中的条款对双方具有法律约束力。因此，是否要求预付款担保，首先应看合同中是否有明确约定。如果合同中明确规定了预付款担保的条款，那么承包方就必须按照合同约定提供预付款担保。
法律法规的指导：
- 虽然《中华人民共和国民法典》等法律法规并未直接规定支付预付工程款必须取得履约担保，但强调了诚实信用原则和保障交易安全的精神。基于此，发包人有权为保障自身权益，要求承包人提供相应的履约担保，包括预付款担保，作为预防损失的一种合理方式。
- 另外，《建设工程价款结算暂行办法》等部门规章也赋予了发包人要求承包人提供预付款担保的权利，担保金额通常与预付款金额相同，形式可采用银行保函、担保公司担保等。这些规定为发包人要求预付款担保提供了法律依据。
行业惯例与地方规定：
- 在建设工程领域，出于风险防控的考虑，许多发包人会在招标文件和施工合同中明确要求承包人提供履约担保，包括预付款担保。同时，部分地方建设行政主管部门也可能出台相关政策，鼓励或要求在工程建设中采用预付款担保等方式，以保障工程的顺利实施和各方合法权益。
建议与注意事项：
明确合同条款：
- 为避免后续纠纷，双方在签订合同时应充分协商并明确相关条款，包括但不限于预付款的支付条件、履约担保的形式和要求、违约责任等。这样可以在合同履行过程中有明确的依据和保障。
风险防控：
- 对于发包人而言，要求承包人提供预付款担保是一种有效的风险防控手段，可以确保资金安全和工程顺利进行。对于承包人而言，提供预付款担保也是展示其诚信和履约能力的一种方式。因此，双方应根据实际情况和风险承受能力来决定是否要求预付款担保。
遵守法律法规与行业规范：
- 在实际操作中，双方当事人应严格遵守国家法律法规和行业规范，确保工程建设的合法性和合规性。如果合同中约定了预付款担保条款，那么承包方就必须按照约定提供担保；如果发包人要求提供预付款担保但合同中未约定，那么双方应协商一致并签订补充协议来明确相关事项。
综上所述，建设工程合同中设置了预付款并不意味着就必须要有预付款担保。这主要取决于合同双方的约定以及相关法律法规和行业惯例的要求。在实际操作中，建议双方当事人充分了解相关法律法规、行业规范及地方政策，并在合同中作出明确约定，以确保各自的权益得到有效保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。