将书房改为卫生间在大多数情况下是不合法的，这主要涉及到建筑结构和用途变更的法律规定。以下从几个方面进行详细分析：

1. 建筑结构安全：

   • 住宅的设计和建造都是基于特定的功能布局和结构安全考虑。书房和卫生间在建筑结构上的要求截然不同，卫生间需要考虑到防水、排水、通风等特殊要求。
   • 如果擅自将书房改为卫生间，可能会破坏原有的建筑结构，导致防水层破损、排水不畅等问题，进而影响房屋的整体结构安全和使用寿命。

2. 用途变更的法律规定：

   • 根据相关法律法规，住宅的使用用途通常需要在规划许可和房产证上明确标注，且不得擅自改变。将书房改为卫生间，实质上是改变了住宅的内部用途，这可能需要经过相关部门的审批和许可。
   • 在没有获得合法审批的情况下擅自改变用途，可能构成违法建设，面临被责令恢复原状、罚款等法律后果。

3. 相邻权保护：

   • 住宅的改造还可能涉及到相邻权的问题。如果改造行为对邻居的正常生活造成了影响，如噪音、异味、漏水等，邻居有权要求停止侵害、恢复原状或赔偿损失。
   • 将书房改为卫生间，如果防水处理不当或排水系统不畅，很可能导致楼下或相邻房间的漏水问题，从而引发邻里纠纷。

4. 实际操作建议：

   • 如果您确实有将书房改为卫生间的需求，建议首先咨询当地的规划部门或建设主管部门，了解相关的法律法规和审批流程。
   • 在获得合法审批后，还需要聘请专业的设计师和施工队伍进行改造，确保改造过程符合建筑安全标准和环保要求。
   • 改造完成后，还需要进行相关的验收和备案手续，以确保改造行为的合法性和安全性。

总结来看，将书房改为卫生间在大多数情况下是不合法的，且可能带来一系列的安全和法律问题。如果您有这方面的需求，建议务必遵守相关法律法规和审批流程，确保改造行为的合法性和安全性。如果您在房产改造方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。