在公证债权文书中，担保人代偿后申请强制执行时，利息的计算需根据具体情况确定，主要分为以下两种情况：
若公证债权文书已明确约定利息计算方式
根据《最高人民法院关于公证债权文书执行若干问题的规定》第九条，若公证债权文书中对利息计算方式（如利率标准、起算时间、计算基数等）有明确约定，且该约定不违反法律强制性规定（如不超过法定利率上限），则执行时直接按照公证文书载明的利息计算方式执行。例如，若约定“代偿后按年利率12%计算利息”，则执行法院会以此为准。
若公证债权文书未明确约定利息计算方式
若公证文书未约定利息或约定不明，则需根据《民法典》及相关司法解释处理：
- 代偿前的利息：若担保人代偿的是主债务人未清偿的债务，且原债权文书对利息有约定，则代偿部分可能包含原约定的利息（需结合代偿范围判断）；
- 代偿后的利息：担保人代偿后，其与主债务人之间形成新的债权债务关系。此时，利息计算可参照《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》中的“逾期利息”规则，即以代偿金额为基数，自代偿之日起按一年期贷款市场报价利率（LPR）的4倍计算（若该标准低于原债权利率，可主张原利率，但不得超过法定上限）。
补充说明：
- 执行过程中，若债务人对利息计算提出异议，法院会审查公证债权文书的合法性及利息约定的合理性。若利息约定被认定无效（如超过法定上限），法院可能调整为法定利率计算。
- 担保人代偿后，建议及时通过公证执行程序申请强制执行，避免因债务人财产变动导致执行困难。若公证文书存在瑕疵（如未赋予强制执行效力），则需通过诉讼程序确认债权后再申请执行。
如有具体案件细节（如公证文书内容、代偿时间、利率约定等），可进一步向我咨询，我会结合实际情况为您详细分析。