原合同是否作废，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合同变更与作废的法律关系
合同变更：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人协商一致，可以变更合同。在建设工程合同中，如果建设单位修改建设内容，且勘察设计单位同意这一变更，那么双方可以签订补充协议或变更协议，对原合同的相关条款进行修改或补充。这种情况下，原合同并未作废，而是通过变更协议对部分内容进行了调整。
合同作废：合同作废通常意味着合同自始无效或被撤销。在建设工程合同中，如果因建设单位修改建设内容导致合同目的无法实现，或者修改内容违反了法律法规的强制性规定，那么合同可能面临作废的风险。但这种情况较为少见，且需要法院或仲裁机构的裁决来确认。
二、建设单位修改建设内容的具体影响
修改内容不重大：如果建设单位修改的建设内容不重大，且不影响合同的整体履行和目的实现，那么双方可以通过协商签订变更协议来调整合同内容，原合同继续有效。
修改内容重大：如果建设单位修改的建设内容重大，导致合同履行成本大幅增加、工期延长或合同目的无法实现等后果，那么双方需要重新协商合同条款。在这种情况下，如果双方无法达成一致意见，可能会面临合同解除或作废的风险。但即使如此，也需要通过法律程序来确认合同的效力状态。
三、法律建议
及时沟通协商：当建设单位提出修改建设内容时，勘察设计单位应及时与建设单位进行沟通协商，明确修改的具体内容、影响及双方的权利义务。通过协商签订变更协议或补充协议来调整合同内容，避免不必要的法律纠纷。
审查修改内容的合法性：在签订变更协议或补充协议前，勘察设计单位应仔细审查修改内容的合法性。确保修改内容不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益。
保留相关证据：在协商和签订变更协议或补充协议的过程中，双方应保留好相关证据，如会议纪要、邮件往来、书面协议等。这些证据在后续可能发生的法律纠纷中具有重要的证明作用。
寻求法律帮助：如果双方在修改建设内容的问题上存在分歧或争议无法解决，建议及时寻求法律帮助。可以咨询专业律师或申请仲裁机构进行仲裁，以维护自身的合法权益。
总结来说，原合同是否作废取决于建设单位修改建设内容的具体情况以及双方协商的结果。在大多数情况下，通过签订变更协议或补充协议可以调整合同内容而无需作废原合同。如果遇到复杂情况或争议无法解决，建议及时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询。