针对您提出的“单位以不能保管档案理由不为员工办理退休手续”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续是用人单位的法定义务。这一义务来源于我国《劳动合同法》的相关规定，即用人单位在解除或者终止劳动合同时，应当出具解除或者终止劳动合同的证明，并在十五日内为劳动者办理档案和社会保险关系转移手续。这一规定同样适用于员工退休的情况，因为退休也意味着劳动关系的终止。
针对您单位提出的“不能保管档案”的理由，这并不能成为拒绝办理退休手续的合法依据。档案保管与办理退休手续是两个不同的环节，单位不能因为档案保管的问题而拒绝履行其法定的办理退休手续的义务。如果单位确实存在档案保管的困难，它应该积极寻求解决方案，如与相关部门协商、寻求专业机构的帮助等，而不是将责任转嫁给员工。
如果单位坚持不为员工办理退休手续，员工可以采取以下措施来维护自己的合法权益：
与单位协商：首先，员工可以尝试与单位进行协商，明确表达自己的诉求和依据，争取单位的理解和配合。虽然《人事争议处理规定》未对协商的时效做出限制，但建议员工在知道权利受到侵害后尽快与单位协商，以避免问题进一步恶化。
申请调解：如果协商无果，员工可以向单位的主管部门或相关调解机构申请调解。调解机构会介入双方之间，帮助双方达成和解协议。同样地，虽然《人事争议处理规定》未明确调解的时效，但建议员工在协商无果后尽快申请调解。
申请劳动争议仲裁：如果调解也无果，员工可以向有管辖权的劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会会依法对争议进行裁决，并出具仲裁裁决书。员工需要在知道或应当知道其权利受到侵害之日起六十日内以书面形式向仲裁委员会申请仲裁。
提起诉讼：如果员工对仲裁裁决不服，还可以在收到裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。法院会依法对案件进行审理，并作出判决。
最后，我想强调的是，员工在维护自己合法权益的过程中，应当保留好相关证据，如劳动合同、解除或终止劳动合同的证明、与单位的沟通记录等。这些证据将有助于员工在协商、调解、仲裁或诉讼过程中证明自己的诉求和依据。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。