结论：偷越国边境罪取保候审结束后，能否补办港澳通行证不能一概而论，需分情况讨论。

1. 案件处理结果对补办通行证的影响

   • 若最终被定罪处罚：根据《中华人民共和国出境入境管理法》第十二条，中国公民有下列情形之一的，不准出境，其中包括“因妨害国（边）境管理受到刑事处罚，自刑罚执行完毕之日起六个月至三年以内不准出境”。因此，若因偷越国边境罪被判处刑罚，在刑罚执行完毕后的特定时间内（六个月至三年），将无法办理港澳通行证及出境。
   • 若案件被撤销、不起诉或无罪判决：若案件最终被撤销、检察院作出不起诉决定，或法院判决无罪，则理论上不存在因该罪行导致的出境限制。但需注意，若存在其他可能影响出境的情形（如正在接受调查、存在未了结的民事案件等），仍可能受到限制。

2. 取保候审期间的特殊情况

   • 取保候审本身并非刑罚，而是一种刑事强制措施。在取保候审期间，若未违反相关规定，且案件未最终定罪，通常不会直接导致出境限制。但需注意，取保候审期间可能需遵守“未经执行机关批准不得离开所居住的市、县”等规定，这可能间接影响办理港澳通行证及出境的计划。

3. 其他可能影响补办通行证的因素

   • 除了案件处理结果外，还需考虑个人信用记录、是否存在其他违法犯罪记录、是否属于法定不准出境人员（如未了结民事案件当事人、有未偿还债务等）等因素。这些因素均可能影响港澳通行证的办理及出境。

建议：

• 了解案件最终处理结果：首先需明确案件是否已最终处理完毕，以及处理结果（如定罪、不起诉、无罪等）。
• 咨询当地出入境管理部门：由于港澳通行证的办理及出境限制涉及具体行政法规及政策，建议直接咨询当地出入境管理部门，以获取最准确、最权威的信息。
• 遵守法律法规：在办理港澳通行证及出境过程中，务必遵守相关法律法规及政策规定，避免因违规行为导致不必要的麻烦。

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