员工自离后，用人单位不发工资的行为在大多数情况下是违法的。不过，具体是否违法还需结合员工的离职行为、公司的相关规定以及是否给公司造成实际经济损失等因素来判断。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第五十条：工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。
- 《工资支付暂行规定》第九条：劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
二、违法性分析
工资支付义务：
- 无论员工因何种原因离职，包括自离，用人单位都有义务支付员工已付出劳动所对应的工资。工资是劳动者提供劳动后应得的报酬，与劳动者的离职方式无关。
自离不影响工资权益：
- 自离只是解除劳动合同的一种方式，它并不影响劳动者已经付出劳动所对应的工资权益。用人单位不得因员工自离就随意克扣或拒绝支付工资。
特殊情况下的处理：
- 如果员工在自离前未按照法律规定或公司规章制度提前通知公司，或未完成交接工作，公司可能根据这些违规行为对员工进行处罚，包括合理扣除部分工资。但此扣除需遵循法律规定，如每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资部分不得低于当地月最低工资标准。
- 若员工的自离行为给公司造成了实际经济损失或影响了正常运营，公司有权要求员工承担相应的赔偿责任。但赔偿的具体数额和方式应通过协商或法律程序确定，不能以此为由拒付工资。
三、员工维权途径
如果公司因员工自离而不发工资，员工可以采取以下合法途径维权：
- 与公司协商：首先尝试与公司进行协商解决，要求公司发放应得工资。
- 向劳动监察部门投诉：若协商无果，可向当地劳动监察部门投诉，由劳动监察部门责令公司限期支付工资。
- 申请劳动仲裁：若问题仍未解决，员工可申请劳动仲裁，通过仲裁程序来维护自己的合法权益。
四、建议与提醒
对于员工：
- 尽管自离不影响工资获取的基本权利，但为了避免不必要的法律纠纷和经济损失，建议劳动者在离职时尽量按照法律规定的程序进行，如提前通知、完成交接等。
- 如遇到公司以自离为由拒绝支付工资的情况，应及时收集并保留相关证据（如工作记录、考勤表、工资条等），以便维权时使用。
对于公司：
- 公司应制定明确的规章制度，规范员工的离职流程和工资支付事宜，确保双方权益得到妥善保障。
- 在处理员工自离问题时，公司应遵循相关法律法规和劳动合同的规定，妥善处理工资支付事宜，避免违法风险。
综上所述，员工自离后，公司应当依法支付其应得的工资。如果公司违反这一规定，员工有权通过法律途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。