结论：针对您提出的“就业协议章子不合格，学校要求发劳动合同，但人不在那儿上班了怎么办”的问题，这主要涉及到就业协议与劳动合同的法律效力及后续处理问题。以下是从不同角度为您提供的详细解答和建议。
一、就业协议与劳动合同的法律效力及区别
法律效力：
- 就业协议：通常是毕业生与用人单位在就业过程中签订的初步协议，具有预约合同的性质，主要约定双方的基本权利和义务，以及后续签订劳动合同的相关事宜。
- 劳动合同：是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议，具有更强的法律约束力，是劳动者与用人单位之间劳动关系的直接证明。
区别：
- 就业协议更多关注于就业意向和初步约定，而劳动合同则详细规定了劳动关系的各个方面，如工作内容、地点、时间、薪酬、福利等。
- 就业协议通常在毕业生离校前签订，而劳动合同则在毕业生正式入职后签订。
二、针对您当前情况的处理建议
与学校沟通：
- 首先，建议您与学校就业指导中心或相关部门沟通，说明您当前的情况，即已经不在原约定单位上班，且就业协议上的章子可能存在问题。
- 询问学校是否可以提供其他解决方案，如重新安排就业单位、出具相关证明等，以协助您顺利毕业和就业。
与原单位协商：
- 如果可能的话，尝试与原单位沟通，说明您已经不在该单位上班，并询问他们是否愿意出具一份解除就业协议的证明或说明。
- 这有助于您向学校证明您与原单位的就业关系已经终止，从而避免学校因就业协议问题而对您产生不利影响。
签订新的劳动合同（如适用）：
- 如果您已经找到了新的工作单位，并且该单位愿意与您签订劳动合同，那么您可以与新单位签订劳动合同，并将此情况告知学校。
- 劳动合同是证明您与新单位劳动关系的重要文件，有助于您顺利毕业和就业。
法律途径：
- 如果学校或原单位坚持要求您提供不符合实际情况的劳动合同或就业协议，并且拒绝协商解决，您可以考虑通过法律途径维护自己的权益。
- 您可以咨询专业律师（即我，郭君律师，专注于劳动纠纷领域），了解您的具体权益和可行的法律救济途径，如提起民事诉讼或申请劳动仲裁等。
三、可能面临的法律后果及预防措施
法律后果：
- 如果您未能妥善处理就业协议和劳动合同的问题，可能会面临学校不予毕业、原单位追究违约责任等不利后果。
- 因此，建议您积极与学校、原单位沟通协商，寻求妥善解决方案。
预防措施：
- 在签订就业协议和劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，确保合同内容真实、合法、有效。
- 保留好相关证据和文件，如就业协议、劳动合同、解除协议的证明等，以备不时之需。
最后，就业协议和劳动合同是毕业生就业过程中的重要文件，务必认真对待。如果您在处理过程中遇到任何问题或困惑，欢迎随时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。