针对您提出的“客运公司违规使用非营运车会怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

客运公司若违规使用非营运车辆进行营运活动，将面临一系列严格的法律处罚。这一行为不仅违反了《中华人民共和国道路运输条例》的相关规定，还可能触犯《中华人民共和国刑法》中关于非法经营罪的规定，因此处罚力度较大。

一、主要处罚措施

1. 责令停止经营：

   • 客运公司若未取得道路运输经营许可，擅自使用非营运车辆从事客运经营，将由县级以上道路运输管理机构责令立即停止经营行为。

2. 罚款：

   • 若客运公司存在违法所得，将没收违法所得，并根据违法所得的金额处以不同倍数的罚款。具体来说，若违法所得超过一定数额（如道路客运经营超过2万元），则处违法所得2倍以上10倍以下的罚款。
   • 若没有违法所得或者违法所得不足上述金额，客运公司也将面临高额罚款，通常处3万元以上10万元以下的罚款。

3. 追究刑事责任：

   • 若客运公司的非法营运行为构成犯罪，如非法经营罪，且情节严重，可能面临五年以上有期徒刑，并处罚金或者没收财产的刑事处罚。

二、其他相关处罚

1. 吊销相关证件：

   • 情节严重的非法营运行为，还可能导致客运公司的相关道路运输经营许可证被吊销，甚至影响公司其他业务的正常开展。

2. 信用记录受损：

   • 违规行为还将被记录在客运公司的信用档案中，对公司未来的经营和发展产生不良影响。

三、合规建议

为了避免上述法律处罚和不良影响，我建议客运公司：

1. 严格遵守法律法规：

   • 确保所有用于营运的车辆都已取得合法的道路运输经营许可，不得使用非营运车辆从事客运经营。

2. 加强内部管理：

   • 建立健全内部管理制度，加强对车辆和驾驶员的管理，确保所有营运活动都符合法律法规的要求。

3. 及时咨询专业律师：

   • 若对相关法律法规存在疑问或不确定之处，应及时咨询专业律师，以了解具体的法律风险和应对策略。

综上所述，客运公司违规使用非营运车将面临严厉的法律处罚，包括责令停止经营、罚款和追究刑事责任等。因此，客运公司应严格遵守相关法律法规，确保营运活动的合法性和安全性。