结论：在立案后款项已退回的情况下，案件是否可以撤销取决于案件的性质、所处的诉讼阶段以及当事人的意愿等多个因素。以下是从不同角度进行的分析：

1. 案件性质与撤销可能性：

   • 民事案件：在民事诉讼中，如果原告在立案后、判决前申请撤诉，且法院认为撤诉不违反法律规定、不损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益，通常会裁定准许撤诉。款项退回可能作为原告撤诉的一个考虑因素，但并非决定性因素，关键在于原告是否主动提出撤诉申请。
   • 刑事案件：在刑事诉讼中，撤诉的情况较为复杂。如果是自诉案件，自诉人在宣告判决前可以同被告人自行和解或者撤回自诉。但如果是公诉案件，则一般不能由当事人自行决定撤诉，除非符合特定条件（如证据不足、情节显著轻微等），且需经检察院或法院审查决定。款项退回在此类案件中通常不是撤诉的直接原因。

2. 诉讼阶段与撤销流程：

   • 立案后至开庭前：在此阶段，如果原告决定撤诉，通常需要向法院提交书面撤诉申请，并说明撤诉理由。法院在审查后，会作出是否准许撤诉的裁定。
   • 开庭后至判决前：即使案件已经开庭，原告仍然有权申请撤诉，但法院在决定是否准许时可能会更加谨慎，特别是考虑到已经进行的诉讼程序和可能产生的诉讼成本。
   • 判决后：一旦案件作出判决，原告通常不能再申请撤诉。但如果对判决结果不服，可以在法定期限内提起上诉或申请再审。

3. 当事人意愿与撤销决定：

   • 撤诉是原告的一项权利，但行使这项权利需要原告主动提出申请。款项退回可能促使原告考虑撤诉，但最终决定应基于原告对案件情况的全面评估和法律判断。
   • 如果被告也同意撤诉，或者双方已经达成和解协议，这通常会增加法院准许撤诉的可能性。

4. 法律后果与注意事项：

   • 撤诉后，原告通常需要承担已经产生的诉讼费用（如案件受理费、保全费等），除非法院另有裁定。
   • 撤诉并不意味着案件彻底结束，如果原告再次就同一事实和理由提起诉讼，法院可能会根据具体情况决定是否受理。
   • 在某些情况下，撤诉可能会影响原告的诉讼时效或权利主张，因此原告在决定撤诉前应充分评估法律后果。

建议：如果您在立案后款项已退回，并考虑撤销案件，建议您首先明确案件的性质和所处的诉讼阶段，然后咨询专业律师（即我，毛武律师，专注于房产纠纷、拆迁安置、合同纠纷等多个领域）以获取具体的法律建议。我可以根据您的具体情况，帮助您分析撤诉的可行性、法律后果以及可能的风险，并协助您准备撤诉申请等相关法律文件。