您好，关于“特种设备指令书是否罚款”的问题，这并非一个绝对的答案，而是取决于具体情况和违规行为的性质。
首先，特种设备指令书通常是市场监管部门或特种设备安全监察机构在检查过程中，发现特种设备使用单位存在安全隐患或违规行为时，下达的一种整改通知。它的主要目的是要求使用单位在规定期限内对存在的问题进行整改，以确保特种设备的安全运行。
在大多数情况下，如果使用单位能够按照指令书的要求及时整改，并消除安全隐患，那么通常不会直接面临罚款。市场监管部门或特种设备安全监察机构会进行复查，确认整改情况后，此事可能就此了结。
然而，如果使用单位未能在规定期限内完成整改，或者整改后仍不符合安全要求，甚至存在严重违规行为（如使用未经检验的特种设备、未配备必要的安全管理人员等），那么就可能面临罚款等行政处罚。罚款的金额会根据违规行为的严重程度、造成的后果以及相关法律法规的规定来确定。
以您提供的两个案例为例：
在“隆安县市场监督管理局行政处罚决定书(桂南隆市监处罚〔2024〕22号)”中，广西**有限公司因未按规定落实特种设备安全主体责任，被罚款人民币伍仟元整。这是因为该公司在接到特种设备安全监察指令书后，未能在规定期限内完成整改，特别是未配备特种设备安全总监和安全员，违反了相关规定。
在“桂北铁市监处罚〔2025〕93号”中，北海市碧拓水泥制品有限公司因使用未经监督检验的特种设备，被罚款人民币叁万元整。这是因为该公司在未经检验且未办理使用登记证的情况下，擅自将特种设备投入使用，严重违反了《中华人民共和国特种设备安全法》的相关规定。
总结来说，特种设备指令书本身并不直接等同于罚款，但它是一种整改通知，要求使用单位在规定期限内完成整改。如果使用单位未能按时整改或整改不合格，就可能面临罚款等行政处罚。因此，建议您在使用特种设备时，务必严格遵守相关法律法规和安全要求，确保设备的安全运行，以避免不必要的法律风险和经济损失。