农田被破坏的问题，一般由当地的农业农村部门或者自然资源部门负责管理。具体来说，可以从以下几个角度来详细分析：
农业农村部门：
- 农田作为农业生产的基础，其保护和管理直接关系到农业生产的稳定和可持续发展。农业农村部门作为农业的主管部门，负责农田的保护、利用和管理等工作。
- 如果农田被破坏是由于非法占用、污染、过度开发等原因导致的，农业农村部门有权进行调查处理，并可以依法对违法行为进行处罚。
自然资源部门：
- 农田作为土地资源的一部分，其规划、利用和保护也受到自然资源部门的监管。自然资源部门负责土地资源的调查、评价、规划、管理和保护等工作。
- 如果农田被破坏涉及到土地用途的改变、非法转让土地使用权等违法行为，自然资源部门将依法进行查处，并恢复土地的原状或采取其他补救措施。
在实际操作中，你可以根据以下步骤来处理农田被破坏的问题：
- 收集证据：首先，你需要收集农田被破坏的相关证据，如照片、视频、证人证言等，以便后续向相关部门举报或投诉。
- 向相关部门举报：根据农田被破坏的具体情况，你可以选择向当地的农业农村部门或自然资源部门进行举报。在举报时，你需要提供详细的证据和情况说明，以便相关部门能够及时了解并处理问题。
- 配合调查处理：在相关部门进行调查处理时，你需要积极配合，提供必要的协助和信息。如果相关部门需要你提供进一步的证据或材料，你也应及时提供。
此外，如果农田被破坏是由于他人的违法行为导致的，你还可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。例如，你可以向法院提起诉讼，要求违法行为人承担民事赔偿责任或刑事责任。
最后，我想强调的是，农田作为宝贵的土地资源，其保护和管理至关重要。如果你发现农田被破坏的情况，请及时向相关部门举报或投诉，并积极配合调查处理工作。同时，如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，也可以直接向我咨询。