面包车座位拆除的处罚主要依据《中华人民共和国道路交通安全法》及相关实施条例，处罚方式包括罚款、责令恢复原状，情节严重的可能扣车或拘留。具体处罚需结合拆除目的、车辆性质及地方规定综合判断。以下是详细分析：

1. 法律定性：擅自改变机动车结构属于违法行为

根据《道路交通安全法》第十六条，任何单位或个人不得擅自改变机动车已登记的结构、构造或特征。面包车座位属于车辆结构的一部分，拆除座位属于“改变机动车结构”的行为，违反了该条款。

2. 处罚依据及标准

• 罚款：根据《道路交通安全法》第九十条，公安机关交通管理部门可对违法行为人处以200元以上2000元以下罚款，具体金额由地方实施细则规定（如部分地区罚款500元）。
• 责令恢复原状：处罚机关会要求车主将车辆恢复至登记状态，否则可能影响年检或过户。
• 扣车或拘留：若拆除座位用于非法营运（如超载拉货）、逃避检查等严重违法行为，可能依据《治安管理处罚法》或《道路运输条例》进一步处罚，包括扣留车辆、行政拘留（如非法营运情节严重）。

3. 情节区分与处罚加重情形

• 一般情形：仅拆除座位未用于其他违法活动，通常按“改变机动车结构”处罚（罚款+恢复原状）。
• 加重情形：
  • 非法营运：拆除座位用于载货或超员运输，可能同时违反《道路运输条例》，面临更高罚款（如3万-10万元）或没收违法所得。
  • 发生事故：若因拆除座位导致车辆安全性下降并引发事故，车主需承担更大民事赔偿责任，甚至涉嫌交通肇事罪。
  • 多次违法：累计处罚后仍不改正的，可能吊销驾驶证或强制报废车辆。

4. 地方性规定的差异

部分地区对面包车改装有更严格的规定，例如：

• 北京、上海：对货运面包车拆除座位拉货的处罚力度较大，可能直接扣车并罚款。
• 广东、浙江：重点查处拆除座位用于“黑客运”的行为，除罚款外还会追究运输企业责任。

5. 建议与风险提示

• 合法改装：若需改变车辆用途（如货运），应向车管所申请变更登记，经批准后改装并更换行驶证。
• 自查风险：拆除座位后若被交警查获，需立即配合处理，避免车辆被扣留导致更大损失。
• 保险免责：擅自改装车辆可能导致保险公司拒赔，发生事故时需自行承担全部损失。

总结：面包车拆除座位的处罚以罚款和恢复原状为主，但若涉及非法营运或事故，处罚会显著加重。建议车主遵守车辆登记用途，如需改装务必通过合法途径申请。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。