营运大客车多次非法出入境的处罚需根据具体违法情形确定，主要涉及行政处罚与刑事处罚两种类型，具体如下：

1. 行政处罚层面
   根据《中华人民共和国出境入境管理法》第七十一条规定，营运大客车未经批准擅自出入境的，对车辆所属单位可处5000元以上5万元以下罚款；对直接负责的主管人员和其他直接责任人员处2000元以上2万元以下罚款。若存在多次违法情形，行政机关可依据《行政处罚法》第二十八条，按“从重处罚”原则提高罚款幅度，例如将单位罚款上限提升至8万元，个人罚款提升至3万元。
   此外，若车辆未按规定办理出入境手续（如未申报载客信息、未携带有效证件等），海关部门可依据《海关行政处罚实施条例》第十二条，对车辆所属单位处货物价值5%-30%的罚款，情节严重的可暂扣或没收车辆。

2. 刑事处罚层面
   若营运大客车多次非法出入境涉及组织他人偷越国（边）境，根据《刑法》第三百一十八条，对组织者处2年以上7年以下有期徒刑，并处罚金；若存在多次组织、人数众多、造成严重后果等情形，可处7年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金或没收财产。
   若车辆被用于走私犯罪（如运输未申报的货物、人员等），根据《刑法》第一百五十三条，走私货物、物品偷逃应缴税额较大或一年内曾因走私被给予二次行政处罚后又走私的，处3年以下有期徒刑或拘役，并处偷逃应缴税额1倍以上5倍以下罚金；情节特别严重的，处10年以上有期徒刑或无期徒刑，并处偷逃应缴税额1倍以上5倍以下罚金或没收财产。

建议：若您或您的单位涉及营运大客车出入境业务，需严格遵守以下程序：

1. 提前向交通运输主管部门申请国际道路运输经营许可；
   
2. 向出入境边防检查机关办理车辆及人员出入境手续；
   
3. 确保车辆符合海关监管要求（如安装GPS定位、携带载货清单等）；
   
4. 定期对驾驶员进行出入境法律法规培训，避免因疏忽导致违法。
   

如有具体案件细节（如违法次数、是否涉及人员或货物走私等），可进一步向我说明，我将结合证据材料提供更精准的法律分析。