针对您提出的“因承包人原因造成工期延误，逾期竣工违约金的计算方法”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：

一、合同约定优先原则

首先，我们需要明确的是，在处理因承包人原因造成的工期延误及逾期竣工违约金问题时，合同约定具有优先性。这意味着，如果发包人与承包人在建设工程施工合同中已经明确约定了逾期竣工违约金的数额或计算方式，并且该约定不违反法律法规的强制性规定和公序良俗，那么通常会按照合同约定来执行。例如，合同可能规定每逾期一天，承包人需按合同总价款的一定比例（如万分之一）支付违约金。

二、违约金的合理调整

尽管合同约定具有优先性，但违约金的数额并非绝对不可调整。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，如果约定的违约金低于造成的实际损失，人民法院或仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；反之，如果约定的违约金过分高于造成的损失，也可以根据请求予以适当减少。

判断标准：在司法实践中，通常以实际损失为基础进行判断。一般认为，违约金超过实际损失的30%可能被认定为“过分高于造成的损失”，此时法院或仲裁机构有权酌情减少违约金数额。

实际损失范围：可能包括发包人因工期延误导致的额外费用支出（如临时租赁场地费用、额外的管理费用等）和预期利益损失（如因工程未能按时投入使用导致的经营收益减少）。

三、逾期竣工违约金的上限

关于逾期竣工违约金的上限，虽然部分观点提及通常不应超过合同总金额的20%，但这并非绝对标准。实际上，违约金的上限应根据具体案件情况和法律规定进行综合判断。在合同中明确约定违约金上限是更为稳妥的做法，但即使合同中有约定，如果违约金数额与实际损失相差悬殊，法院或仲裁机构仍可能根据实际情况进行调整。

四、特殊情况的处理

• 免责事由：如果承包人能够证明逾期竣工非因其原因造成，如发包人提供的材料延迟到货、设计变更或不可抗力因素等，那么承包人可能无需承担逾期竣工的违约责任。
• 协商与调解：在发生工期延误和违约金争议时，双方应首先尝试通过协商或寻求中立第三方进行调解来解决争议。这有助于维护双方的合作关系并降低解决成本。
• 仲裁或诉讼：若协商和调解均无法解决问题，根据合同中的仲裁条款或双方事后达成的仲裁协议，可将争议提交给约定的仲裁机构进行仲裁；若无仲裁约定，则可通过向有管辖权的人民法院提起诉讼来解决纠纷。

五、建议与预防措施

• 明确合同条款：双方在签订合同时应明确约定工期、质量标准、违约责任等相关条款，特别是逾期竣工违约金的计算方法和上限，以减少后续争议的发生。
• 加强监督与管理：发包人应定期对工程进度进行监督，确保工程按照计划进行；承包人也应加强自身管理，提高施工效率和质量意识，避免因自身原因导致工期延误。

综上所述，因承包人原因造成的工期延误及逾期竣工违约金的处理应遵循合同约定优先、合理调整以及特殊情况特殊处理的原则。在实际操作中，应综合考虑合同条款、法律法规、实际损失以及双方过错程度等因素，以确保公平合理地解决纠纷。