结论概述：办理酒店离店手续超时是否会扣押金，这主要取决于租赁合同（或酒店入住协议）中的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是从不同角度对此问题的详细分析。
合同约定角度：
- 合同条款：首先，需要查看您与酒店签订的租赁合同或入住协议中是否有关于离店时间、押金退还条件及超时处理的具体条款。如果合同中明确规定了离店时间，并指出超时将扣除一定比例的押金作为违约金或赔偿金，那么酒店有权按照合同约定执行。
- 示例说明：假设合同中规定“客人应在中午12点前办理离店手续，否则将扣除当日房费的50%作为押金赔偿”。在此情况下，如果您超时未办理离店手续，酒店有权根据合同扣除相应押金。
法律法规角度：
- 消费者权益保护：根据《中华人民共和国消费者权益保护法》等相关法律法规，消费者在接受服务时有权获得公平、合理的交易条件。酒店作为服务提供者，不得设置不公平、不合理的交易条件或格式条款。
- 押金退还：如果合同中没有明确规定超时扣押金的条款，或者该条款被认定为不公平、不合理，那么酒店无权单方面扣除押金。在此情况下，您有权要求酒店全额退还押金。
- 法律依据：虽然直接针对酒店离店超时扣押金的法律法规可能并不明确，但您可以依据《消费者权益保护法》中的相关规定来维护自己的合法权益。
实际操作建议：
- 提前沟通：在入住酒店时，建议您与酒店工作人员明确离店时间，并了解酒店对于超时离店的处理方式。如果可能的话，尽量将相关约定写入合同或入住协议中，以避免后续纠纷。
- 保留证据：如果酒店确实扣除了您的押金，而您认为这一行为不合理或违反了合同约定，建议您保留好相关证据（如合同、入住凭证、扣款通知等），以便在需要时向酒店或相关部门投诉或维权。
- 协商解决：在发生纠纷时，您可以首先尝试与酒店进行协商解决。如果协商无果，您可以向当地消费者协会、旅游投诉受理机构或相关行政部门投诉，或者通过法律途径解决纠纷。
总结与提醒：办理酒店离店手续超时是否会扣押金，关键在于合同中的具体约定以及相关法律法规的规定。在入住酒店时，请务必仔细阅读合同条款，了解自己的权利和义务。如果遇到纠纷或疑问，请及时向我咨询，我将根据您的具体情况提供专业的法律建议。