结论：在签署离职合同时，工资一般应当结清，但具体是否结清以及结清的时间和方式，可能因劳动合同的约定、公司规章制度以及相关法律法规的规定而有所不同。以下从多个角度进行详细分析：
一、法律法规角度
《中华人民共和国劳动法》相关规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第五十条：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这一条款明确了工资支付的基本原则，即工资应当按月支付，且不得克扣或无故拖欠。
- 在离职的情况下，虽然法律没有明确规定离职时工资必须立即结清，但根据工资支付的原则，劳动者有权要求用人单位在离职时结清工资，除非双方另有约定或法律法规另有规定。
《中华人民共和国劳动合同法》相关规定：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第三十七条规定：“劳动者提前三十日以书面形式通知用人单位，可以解除劳动合同。劳动者在试用期内提前三日通知用人单位，可以解除劳动合同。”这一条款规定了劳动者解除劳动合同的通知期限，但并未直接涉及离职时工资的结清问题。
- 然而，结合《劳动法》关于工资支付的规定，可以推断出，在劳动者按照法定程序解除劳动合同后，用人单位应当结清劳动者的工资。
二、劳动合同与公司规章制度角度
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了离职时工资的结清时间和方式，那么双方应当按照劳动合同的约定执行。
- 例如，劳动合同可能约定离职时一次性结清所有工资，或者约定在离职后的某个特定日期支付剩余工资。
公司规章制度：
- 有些公司可能在其规章制度中规定了离职时工资的结清流程和时间。如果这些规章制度不违反法律法规的规定，且劳动者在入职时已经知晓并同意，那么这些规章制度对双方具有约束力。
- 但需要注意的是，公司规章制度不能违反法律法规的强制性规定，否则将被视为无效。
三、实际操作建议
与用人单位协商：
- 在签署离职合同时，劳动者可以与用人单位就工资的结清问题进行协商，并明确约定在离职合同中。
- 如果双方能够达成一致意见，那么可以按照协商的结果执行。
保留相关证据：
- 劳动者在离职前应当保留好与工资支付相关的证据，如工资条、银行转账记录等。
- 这些证据在后续可能发生的劳动争议中具有重要的证明作用。
寻求法律援助：
- 如果用人单位拒绝结清工资或者存在其他违法行为，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉或者寻求法律援助。
- 在必要时，劳动者还可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁或者向人民法院提起诉讼。
举例说明：假设劳动者小张与用人单位签订了劳动合同，并在合同中约定了离职时一次性结清所有工资。后来，小张因个人原因提出离职，并与用人单位签署了离职合同。在签署离职合同时，小张应当要求用人单位按照劳动合同的约定结清工资。如果用人单位拒绝结清或者拖延支付，小张可以保留好相关证据，并向当地劳动监察部门投诉或者寻求法律援助。
特殊情况说明：在某些特殊情况下，如用人单位因经营困难等原因确实无法立即结清工资，双方可以协商延期支付或者分期支付。但这种情况下，双方应当签订书面协议，并明确约定支付的时间和方式等条款。
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