商业用地使用年限到期后，主要可通过申请续期并缴纳土地出让金的方式继续使用土地，若未获批准或未申请续期，则土地使用权由国家收回。具体分析如下：

1. 申请续期：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第三百五十九条，非住宅建设用地使用权期限届满后的续期，需依照法律规定办理。对于商业用地，通常意味着使用权人需在期限届满前一年提出续期申请。
   • 续期申请需获得相关政府部门的批准，并需按照当时的地价水平补缴土地出让金。土地出让金的数额通常由政府根据土地的市场价值、用途、位置等因素综合确定。
   • 若续期申请获得批准，使用权人需签订新的土地使用权出让合同，并支付土地出让金，从而获得新的土地使用权期限。

2. 未获批准或未申请续期的处理：

   • 若使用权人未在规定期限内提出续期申请，或提出的续期申请未获得政府批准，则土地使用权将由国家无偿收回。
   • 在土地使用权被收回前，使用权人需对土地上的建筑物、构筑物及其附属设施进行处理。根据法律规定，国家收回土地使用权时，对建筑物、构筑物及其附属设施通常不予补偿，除非另有约定或法律规定。
   • 若使用权人希望保留建筑物、构筑物及其附属设施，需在土地使用权期限届满前与政府协商，看是否能够通过其他方式（如转让、租赁等）继续使用土地或获得相应补偿。

3. 特殊情况下的处理：

   • 在某些特殊情况下，如因公共利益需要，政府可能提前收回土地使用权。此时，政府需按照法律规定给予使用权人相应的补偿。
   • 若使用权人在土地使用权期限内违反了土地使用权出让合同或相关法律法规的规定，政府也有权提前收回土地使用权，并可能不予补偿或仅给予部分补偿。