结论：在基本农田上种果树一般不合法，种了可能面临责令改正、罚款等后果，变更基本农田用途需按法定程序申请。以下是详细说明：

一、在基本农田上种果树是否合法

根据《基本农田保护条例》第十七条规定，禁止任何单位和个人在基本农田保护区内建窑、建房、建坟、挖砂、采石、采矿、取土、堆放固体废弃物或者进行其他破坏基本农田的活动，同时也禁止占用基本农田发展林果业。所以，在基本农田上种果树通常是不合法的。

二、在基本农田上种果树的后果

1. 责令改正：如果被发现违反规定在基本农田上种果树，县级以上地方人民政府土地行政主管部门会责令限期改正或者治理，要求恢复基本农田的原状，拆除果树等种植设施。
2. 罚款：除了责令改正外，还可能会并处罚款。罚款的具体数额会根据违法行为的情节轻重、造成的后果等因素，由土地行政主管部门依据相关法律法规进行确定。例如，对于情节较轻的，可能处以较低数额的罚款；而对于情节严重、造成较大损失的，罚款数额会相应提高。
3. 其他后果：如果种植果树的行为对基本农田造成了严重破坏，构成犯罪的，还将依法追究刑事责任。

三、如何申请变更基本农田用途

如果确实需要在基本农田上进行非农业建设或者改变用途用于种植果树等，需要按照法定程序进行申请变更：

1. 提出申请：由需要使用土地的单位或者个人向乡（镇）人民政府提出用地申请。申请时需要提交相关的材料，如项目可行性研究报告、规划选址意见书等，以说明变更用途的必要性和合理性。
2. 审核与上报：乡（镇）人民政府会对申请进行审核，如果认为符合条件，会将申请上报给县级人民政府土地行政主管部门。县级土地行政主管部门会对申请进行进一步的审查，包括对土地的权属、地类、面积等进行核实，以及对项目的合规性进行评估。
3. 审批：经过审查后，如果申请符合土地利用总体规划和相关法律法规的规定，县级人民政府土地行政主管部门会提出审批意见，并报有批准权的人民政府批准。对于基本农田的变更用途，通常需要经过省级人民政府或者国务院的批准。
4. 办理手续：在获得批准后，需要按照规定办理相关的土地变更登记手续，领取新的土地使用证书，明确土地的新用途和使用期限等。

如果你在基本农田相关问题上还有其他疑问，或者需要进一步的法律帮助，欢迎随时向我咨询。