结论：荒置的水田围起来养鸡鸭是否属于违章建设，需根据具体情况判断，主要涉及土地用途变更的合法性、建设行为的合规性以及是否符合当地规划要求等多个方面。以下从不同角度进行分析：
一、土地用途变更的合法性
土地性质与用途：
- 水田属于农用地，根据《土地管理法》等相关法律法规，农用地主要用于农业生产活动。若要将水田用于非农业生产（如养鸡鸭），需依法办理土地用途变更手续，即农用地转用审批。
- 若未办理相关手续，直接在水田上围起来养鸡鸭，可能构成擅自改变土地用途的违法行为。
审批流程：
- 农用地转用需经过县级以上人民政府批准，并可能涉及土地征收、补偿安置等程序。
- 若未经批准，擅自改变土地用途，可能面临土地管理部门的处罚，包括责令限期改正、罚款等。
二、建设行为的合规性
建设许可：
- 在土地上建设养殖设施（如鸡舍、鸭舍等），通常需要办理建设用地规划许可证、建设工程规划许可证等手续。
- 若未取得相关许可，直接进行建设，可能构成违章建设。
建设标准：
- 即使取得了建设许可，养殖设施的建设也需符合当地的建设标准、环保要求等。
- 若建设不符合标准，如未达到环保要求、存在安全隐患等，也可能面临相关部门的处罚。
三、符合当地规划要求
土地利用总体规划：
- 土地利用需符合当地土地利用总体规划，包括农用地、建设用地、未利用地的布局和安排。
- 若养殖设施的建设与当地土地利用总体规划不符，如位于禁止建设区域、生态保护红线内等，可能构成违章建设。
乡村规划：
- 在农村地区，还需考虑乡村规划的要求。乡村规划通常对村庄布局、基础设施建设、产业发展等有具体规定。
- 若养殖设施的建设与乡村规划不符，如影响村庄整体风貌、破坏生态环境等，也可能面临相关部门的处罚。
四、特殊情况与建议
设施农用地政策：
- 根据相关政策，对于直接用于或者服务于农业生产，与生产直接关联的设施用地，如养殖场、农资仓库等，可能享受一定的政策优惠或简化审批流程。
- 但需注意，即使属于设施农用地，也需依法办理相关手续，并符合当地规划要求。
建议与行动：
- 在行动前，建议先咨询当地土地管理部门或农业农村部门，了解相关政策、手续和要求。
- 若已建设，但未办理相关手续或不符合规划要求，建议尽快补办手续或调整建设方案，以避免面临处罚或拆除的风险。
总结：荒置的水田围起来养鸡鸭是否属于违章建设，需综合考虑土地用途变更的合法性、建设行为的合规性以及是否符合当地规划要求等多个方面。如有具体疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。