结论：旷工一天扣六天工资且剩余天数按基本工资算的做法，一般是不合法的。以下从多个角度进行分析：
法律角度
工资扣除的合法性：
- 根据《工资支付暂行规定》第十六条，因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
- 旷工一天扣六天工资的做法，显然超出了上述法律规定的扣除比例，因此是不合法的。
剩余天数按基本工资算的合法性：
- 工资通常包括基本工资、奖金、津贴等组成部分。如果劳动合同或公司规章制度中明确规定了工资的构成和计算方式，且剩余天数按基本工资算的做法符合这些规定，同时不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法可能是合法的。
- 然而，如果这种做法导致劳动者的实际工资低于当地最低工资标准，或者没有合理的依据和程序支持，那么它同样是不合法的。
实际操作角度
公司规章制度：
- 公司规章制度应当经过民主程序制定，并公示或告知劳动者。如果公司规章制度中规定了旷工一天扣六天工资且剩余天数按基本工资算的做法，但这一规定没有经过民主程序制定或未公示/告知劳动者，那么该规定对劳动者不具有约束力。
劳动合同约定：
- 劳动合同是劳动者和用人单位之间约定权利和义务的重要文件。如果劳动合同中明确约定了旷工一天扣六天工资且剩余天数按基本工资算的做法，且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么该约定可能是有效的。但如前所述，这种约定很可能因违反工资扣除的法定比例而无效。
建议
对于劳动者：
- 如果遇到公司旷工一天扣六天工资且剩余天数按基本工资算的做法，可以先与公司协商解决。
- 如果协商无果，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，维护自己的合法权益。
对于用人单位：
- 应当制定合法、合理的规章制度和劳动合同条款，避免侵犯劳动者的合法权益。
- 在处理旷工等违纪行为时，应当遵循法律法规的规定和劳动合同的约定，确保处理结果的合法性和合理性。
示例说明：假设某劳动者的月工资为5000元，旷工一天后，公司按照旷工一天扣六天工资且剩余天数按基本工资（假设为3000元）算的做法进行处理。那么，该劳动者实际到手的工资将远低于其应得工资，且很可能低于当地最低工资标准。这种做法显然是不合法的，劳动者有权向公司提出异议或向相关部门投诉。
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