针对您提出的“虚开发票过三年了如何处罚”的问题，这确实是一个涉及法律条款和具体情节判断的复杂问题。以下是我根据相关法律法规和司法实践，为您提供的详细解答：

一、虚开发票罪的基本法律规定

根据《中华人民共和国刑法》第二百零五条及相关规定，虚开发票罪是指为他人、为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，让他人为自己开具与实际经营业务情况不符的发票，以及介绍他人开具与实际经营业务情况不符的发票的行为。这种行为严重扰乱了税收管理秩序，因此会受到法律的严厉制裁。

二、虚开发票罪的处罚原则

虚开发票罪的处罚涉及罚款、没收违法所得及刑事处罚，具体标准依据虚开发票的金额、情节严重程度及犯罪主体身份综合判定。即使虚开发票的行为已经过去三年，只要被发现并查实，仍然会受到相应的法律处罚。

三、具体量刑标准及罚款细则

1. 罚款与没收违法所得：

   • 虚开发票金额在1万元以下的，可并处5万元以下罚款。
   • 金额超过1万元的，并处5万元以上50万元以下罚款。
   • 无论金额大小，均须没收违法所得。

2. 量刑细化（基于虚开税款数额或发票份数、金额）：

   • 对于虚开增值税专用发票或用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票：
     • 虚开的税款数额在五万元以上的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处二万元以上二十万元以下罚金。
     • 虚开的税款数额较大（如50万元以上不满250万元），或者有其他严重情节的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金。
     • 虚开的税款数额巨大（如250万元以上），或者有其他特别严重情节的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处五万元以上五十万元以下罚金或者没收财产。
   • 对于虚开普通发票：
     • 情节严重的（如虚开发票100份以上或虚开金额累计在40万元以上），处二年以下有期徒刑、拘役或者管制，并处罚金。
     • 情节特别严重的（如虚开发票500份以上或虚开金额累计在200万元以上），处二年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

四、影响量刑的其他因素

• 自首与立功：如果犯罪嫌疑人在案发后能够自首或立功，根据法律规定，可以从轻或减轻处罚。如果犯罪较轻，甚至有可能免除处罚。
• 认罪认罚从宽：如果犯罪嫌疑人自愿认罪并接受处罚，根据认罪认罚从宽的原则，可以依法从宽处理。

五、特殊情况下的从严惩处

• 如果虚开发票的行为涉及税收管理重要人员利用职务便利为他人虚开发票骗取税款，或者组织多人进行虚开，或者明知他人为恐怖活动、洗钱、黑社会性质组织活动等犯罪而虚开发票的，这些情况下都会从严惩处。

六、关于“过三年”的说明

虽然虚开发票的行为已经过去三年，但根据我国刑法的规定，犯罪的追诉期限是根据犯罪的法定最高刑来确定的。对于虚开发票罪，其追诉期限可能较长，特别是当涉及较大金额或严重情节时。因此，即使行为已经过去三年，只要在追诉期限内被发现并查实，仍然会受到法律的制裁。

七、建议

鉴于虚开发票罪的严重性和复杂性，我建议您或相关企业严格遵守税法规定，确保发票的真实性和合法性。如果发现任何虚开发票的行为或嫌疑，应立即向税务机关或公安机关报告，并配合相关部门的调查和处理工作。

综上所述，虚开发票罪的处罚是一个综合考虑多方面因素的复杂过程。在实际操作中，法院会根据具体情况结合上述法律规定和量刑标准作出公正合理的判决。因此，请务必遵守相关法律法规，避免触碰法律红线。