结论：政府在农村修排污管道后，仅回填部分道路而要求村民付费修复剩余部分是否合法，需分情况讨论，具体如下：

1. 若政府行为属于法定职责范围
   根据《中华人民共和国公路法》第八条及《村庄和集镇规划建设管理条例》第四条，农村道路的规划、建设、养护通常属于政府职责范畴。若排污管道工程本身包含道路修复义务（例如因施工导致道路破损），则政府应全额承担修复费用。此时要求村民付费属于行政不作为或乱收费，村民可向乡镇政府或县级交通主管部门投诉，或通过行政复议、诉讼主张权利。

2. 若政府行为超出法定职责范围
   若道路修复不属于政府法定职责（例如道路原为村民自建或集体所有），且政府在施工前已通过公告、协议等形式明确告知村民“仅修复管道涉及部分，其余由村民自行处理”，则可能构成合法民事约定。但需满足以下条件：

   • 村民事先知情并同意（如签字确认）；
     
   • 收费标准合理（不得高于市场价）；
     
   • 资金使用透明（需专项用于道路修复）。
     若未满足上述条件，村民仍有权拒绝付费。

3. 特殊情形：政府与村民协商分担费用
   若道路修复属于“受益者分担”原则范畴（例如管道工程显著提升村民生活环境，且政府因财政困难无法全额承担），政府可与村民协商按比例分担费用。但需注意：

   • 协商过程需公开透明，不得强制；
     
   • 分担比例需合理（如政府承担70%，村民承担30%）；
     
   • 需签订书面协议明确权利义务。
     若协商未达成一致或程序违法，村民可拒绝付费。

建议行动步骤：

1. 收集证据：保留政府公告、施工合同、缴费通知等书面材料；
   
2. 核实性质：向村委会或乡镇政府确认道路权属及政府职责范围；
   
3. 协商沟通：联合其他村民与政府协商，要求出具收费依据；
   
4. 法律途径：若协商无果，可向县级政府法制办申请行政复议，或直接向法院提起行政诉讼。
   

温馨提示：农村基础设施建设项目常涉及多方资金来源，建议优先通过协商解决。若需进一步分析具体证据或程序，可随时向我提供细节，我会为您详细解答。