产假期间扣发年终奖通常是不合法的，但具体还需结合公司规章制度及劳动合同内容来判断。以下从多个角度为您详细分析：
一、法律依据与年终奖性质
法律依据：
- 根据《女职工劳动保护特别规定》第八条，女职工产假期间停发工资，改发生育津贴，且该津贴标准不得低于女职工原工资标准。这一规定确保了女职工在产假期间的经济权益。
- 《中华人民共和国劳动法》第五十一条也明确指出，劳动者在法定休假期间，用人单位应依法支付工资，工资包括奖金等组成部分。年终奖作为奖金的一种，自然也属于工资范畴。
年终奖性质：
- 年终奖是工资总额的重要组成部分，具有激励员工的作用。国家统计局的相关规定也明确了奖金（包括年终奖）属于工资范畴，因此，女职工在产假期间应被视为正常出勤，并有权获得相应的年终奖金额。
二、公司规章制度与劳动合同的约定
规章制度合法性：
- 如果公司规章制度明确规定年终奖与员工全年实际出勤情况挂钩，并在计算时对产假期间进行了合理折算，同时该制度已向员工公示告知，且不违反国家法律法规的强制性规定，那么扣除年终奖可能具有一定合理性。但这种情况在实践中存在争议，需结合具体情况和证据来判断。
劳动合同约定：
- 如果劳动合同中明确约定了年终奖的发放条件，且这些条件不违反法律法规的强制性规定，同时女职工在产假期间不符合发放条件，那么公司可能有权不发放年终奖。但这种情况较为少见，且公司需承担举证责任。
三、特殊情况下的考量
- 在实际操作中，如果公司对类似出勤情况的其他员工发放了年终奖，而对休产假的女职工不发，这种做法可能被认定为不合理的差别对待，女职工有权通过协商、仲裁等途径维护自身权益。
四、违法后果与维权途径
违法后果：
- 如果公司擅自扣除女职工产假期间的年终奖，实际上构成了对工资的克扣行为，违反了相关法律法规。根据《中华人民共和国劳动法》，用人单位克扣或者无故拖欠劳动者工资的，由劳动行政部门责令支付劳动者的工资报酬、经济补偿，并可以责令支付赔偿金。
维权途径：
- 女职工在此情况下有权与公司协商解决；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在维权过程中，女职工应保留好相关证据，如劳动合同、公司规章制度、工资条等，以便在需要时提供证明。
五、实际操作建议
- 提前沟通：建议女职工在产假前与公司相关部门沟通确认年终奖的发放政策，确保自己的权益得到保障。
- 审查合同与制度：女职工应了解并审查公司规章制度及劳动合同中关于年终奖发放的规定，特别是是否包含对产假期间女职工的特殊考虑。
- 及时维权：如遭遇不公，女职工应依法及时维权，避免错过维权时机。
总结来说，产假期间扣发年终奖通常是不合法的，但具体还需结合公司规章制度及劳动合同内容来判断。女职工应了解自己的合法权益，并在必要时采取适当措施维护自身权益。如果您有进一步的疑问或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。