结论：第二轮土地承包时，若户主为事业单位干部，能否承包土地需分情况讨论，具体如下：

1. 事业单位干部身份与土地承包资格的关系
   根据《农村土地承包法》第五条，农村集体经济组织成员有权依法承包本集体经济组织发包的农村土地。事业单位干部若同时具备农村集体经济组织成员身份（如户籍在农村、未脱离原集体经济组织），则依法享有承包资格；若已转为非农业户口或脱离原集体（如通过招工、升学等方式取得城镇户籍），则可能丧失成员资格，原则上不能承包。

2. 第二轮土地承包的特殊政策背景
   第二轮土地承包（1997-2003年）以“增人不增地、减人不减地”为原则，承包期30年不变。若事业单位干部在第二轮承包时已具备成员身份，即使后续身份变化（如考入事业单位），其承包地通常不受影响，可继续承包至期满（2027年左右）。但若承包时已丧失成员资格，则无权承包。

3. 实践中的例外情形

   • “空挂户”问题：若干部户籍虽在农村，但长期未履行集体义务（如未缴纳公益金、未参与集体事务），可能被认定为“空挂户”，集体有权收回土地。
     
   • 政策性限制：部分地区对公职人员承包土地有额外限制（如禁止承包经营性土地），需结合当地政策判断。
     
   • 家庭承包的特殊性：若土地以家庭为单位承包，户主为干部但其他家庭成员具备成员资格，则家庭仍可承包，但干部本人可能不直接享有权益。

4. 建议与风险提示

   • 核实成员资格：通过户籍档案、集体经济组织章程等证明成员身份。
     
   • 审查承包合同：确认合同是否符合法定程序（如民主议定、公开竞标等）。
     
   • 关注政策变化：部分地区正在推进土地承包期再延长30年试点，需关注后续政策对干部承包资格的影响。
     

总结：事业单位干部能否承包土地，核心在于其是否具备农村集体经济组织成员身份。若身份存疑或承包程序违法，可能面临土地被收回的风险。如有具体案例，可进一步提供细节，我将为您分析法律风险及应对方案。