结论：公司贷款居间费用超过3%（假设这里的“3”指的是3%的比例）是否违法，不能一概而论，需结合具体法律法规、合同约定以及行业惯例等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：

1. 法律法规层面

• 居间合同法律规定：根据《中华人民共和国民法典》中关于居间合同（现称为中介合同）的规定，居间人促成合同成立的，委托人应当按照约定支付报酬。报酬的数额和支付方式由双方约定，但不得违反法律、行政法规的强制性规定。
• 利率或费用限制：对于贷款居间费用，虽然直接的法律条文可能并未明确规定上限，但需注意，如果居间费用与贷款利息、其他费用等合计超过法定利率上限（如民间借贷的利率上限，根据最新规定，为合同成立时一年期贷款市场报价利率四倍），则可能被视为高利贷，超出部分不受法律保护。不过，这一规定主要针对的是贷款利息，而非居间费用本身。但实践中，如果居间费用过高，也可能引发监管部门的关注。
• 行业监管规定：某些行业或地区可能对贷款居间费用有具体的监管规定或行业自律准则，如果居间费用超过这些规定或准则，则可能被视为违法或违规。

2. 合同约定层面

• 双方自愿约定：居间费用的大小首先取决于双方当事人的自愿约定。只要双方意思表示真实，且不违反法律、行政法规的强制性规定，那么约定的居间费用就是有效的。
• 显失公平原则：如果居间费用明显过高，超出了合理范围，且没有合理的解释或依据，那么可能构成显失公平。在这种情况下，受损害方有权请求人民法院或仲裁机构予以变更或撤销合同中的相关条款。

3. 行业惯例与市场情况

• 行业惯例：不同行业、不同地区的贷款居间费用可能存在差异。如果某笔贷款的居间费用明显高于当地或该行业的平均水平，且没有合理的解释或依据，那么可能引发质疑。
• 市场情况：市场供求关系也会影响居间费用的大小。在供不应求的情况下，居间费用可能相对较高；而在供过于求的情况下，居间费用则可能相对较低。

4. 法律后果与建议

• 法律后果：如果居间费用被认定为违法或违规，那么超出部分可能不受法律保护，甚至可能面临行政处罚或刑事责任（如构成非法经营罪等，但这种情况较为罕见）。
• 建议：
  • 在签订居间合同时，双方应明确约定居间费用的数额和支付方式，并确保符合法律法规和行业惯例。
  • 如果对居间费用有疑问或争议，可以咨询专业律师或相关监管部门，以获取更准确的法律意见和指导。
  • 在实际操作中，应保持谨慎和理性，避免盲目追求高收益而忽视潜在的法律风险。

总结：公司贷款居间费用超过3%是否违法，需结合具体法律法规、合同约定以及行业惯例等多方面因素综合判断。如果有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。