冒用他人名义作为公司雇员抵扣税款属于违法行为，需承担行政责任甚至刑事责任，同时可能面临民事赔偿。具体处理方式需结合行为性质、后果及主观故意程度综合判断，以下是详细分析：

一、行政责任：税务机关的处罚

若公司通过伪造员工信息、虚构工资薪金等方式虚假申报个税专项附加扣除或偷逃税款，税务机关将依据《税收征收管理法》第六十三条追究行政责任：

1. 追缴税款：要求补缴应纳税款；
2. 滞纳金：按日加收万分之五的滞纳金；
3. 罚款：处不缴或少缴税款50%以上5倍以下罚款；
4. 信用惩戒：将企业纳入税收违法“黑名单”，影响招投标、融资等经营活动。

典型案例：某企业虚构20名员工工资偷逃企业所得税，被追缴税款及滞纳金共计120万元，并处罚款60万元。

二、刑事责任：可能构成逃税罪

若行为符合《刑法》第二百零一条逃税罪构成要件：

1. 数额标准：逃税数额占应纳税额10%以上且超过10万元，或因逃税受过二次行政处罚又逃税的；
2. 处罚：处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大且占应纳税额30%以上的，处三年以上七年以下有期徒刑，并处罚金。

关键点：若企业在税务机关下达追缴通知后补缴税款、滞纳金并接受行政处罚，可不追究刑事责任（但五年内因逃避缴纳税款受过刑事处罚或被税务机关给予二次以上行政处罚的除外）。

三、民事责任：对被冒用者的赔偿

若被冒用者因此遭受损失（如影响个人征信、无法享受税收优惠等），可依据《民法典》第一百七十九条要求公司承担：

1. 停止侵害：消除虚假申报记录；
2. 赔偿损失：包括误工费、交通费、信用修复费用等；
3. 赔礼道歉：通过公开方式消除影响。

操作建议：被冒用者应第一时间向税务机关举报，并留存工资流水、社保记录等证据，通过行政投诉或民事诉讼维权。

四、企业合规建议

1. 自查整改：立即停止冒用行为，主动向税务机关说明情况并补缴税款；
2. 完善内控：建立员工信息核验机制，避免使用虚假身份；
3. 法律培训：定期组织财务、人事部门学习税法及刑事风险，强化合规意识。

提示：若您或企业涉及此类问题，建议携带相关材料（如税务处理决定书、员工合同等）向我详细咨询，我将结合具体情节制定应对方案。