撤案后，一般情况下不会留下案底，但公安机构可能会保留相关调查记录，这些记录并不等同于案底，对个人的影响也相对较小。以下是对这一问题的详细分析：

一、案底的定义与撤案的关系

1. 案底定义：案底通常指的是犯罪记录，即某人过去犯法或犯罪行为的记录，它主要基于法院的刑事审判和有罪判决来形成。
2. 撤案含义：撤案意味着法院没有对行为人进行刑事审判，也没有作出有罪判决。因此，从法律意义上来说，行为人不构成犯罪，也就不会留下案底。

二、不同类型案件撤案的情况

1. 刑事案件：

   • 侦查阶段撤案：在侦查过程中，若公安机关发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，如案件属于误会、所谓的“犯罪行为”实际并未发生，或犯罪嫌疑人的行为情节显著轻微、危害不大且不认为是犯罪，应当撤销案件。此情况下，因未认定犯罪嫌疑人构成犯罪，故不会留下案底。
   • 审查起诉阶段撤案：检察机关在审查起诉时，若发现犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或存在《刑事诉讼法》第十六条规定的情形（如情节显著轻微、危害不大；犯罪已过追诉时效期限等），应作出不起诉决定。对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或免除刑罚的，检察院也可作出不起诉决定。这两种不起诉决定均意味着犯罪嫌疑人不会被交付审判，因此不会有犯罪记录，即不会留下案底。但需注意，若是检察院作出的酌定不起诉决定，其不起诉决定书会存入个人档案，可能视为一种特殊记录，不过这种记录并不等同于案底，对个人的影响也相对较小。

2. 特殊情况：

   • 在某些特定的自诉案件中，若被害人与被告人达成和解协议，被害人主动撤回起诉，且犯罪事实确实存在，只是基于被害人的意愿而撤案，严格来说行为人的行为依然构成犯罪。但由于没有经过法院的有罪判决，从通常所理解的“案底”（即犯罪记录）角度，可能不会在官方的犯罪记录档案中留下记录。然而，司法机关处理案件过程中形成的相关材料可能会有留存。

三、撤案后可能存在的记录

• 即使案件撤案没有犯罪记录，但在案件办理过程中，若发现有相关的行政违法行为并给予了行政处罚（如罚款、行政拘留等），则会留下行政处罚的记录。这种记录虽不同于犯罪案底，但也属于一种不良记录，可能对个人的未来产生一定影响，比如在申请特定行业许可证时可能会受到一定限制。

四、撤案后的法律救济

• 即使案件被撤销，如果涉及到财务纠纷或者人身伤害等民事责任，当事人仍然可以通过民事诉讼等途径寻求法律救济。撤销案件并不意味着所有法律问题的终结。

五、建议

• 虽然撤案后一般不会留下案底，但为了确保自身权益得到妥善保护，建议当事人在撤案后仍要关注可能存在的民事责任和其他法律问题。如果对此有更多疑问或需要更具体的法律建议，可以直接向我咨询。

综上所述，撤案后一般不会留下案底，但公安机构可能会保留相关调查记录。同时，撤销案件并不意味着所有法律问题的终结，当事人仍需关注可能存在的民事责任和其他法律问题。