存疑不起诉被不起诉人确实可以申诉。以下是对这一问题的详细分析：

1. 法律依据与申诉权利：

   • 根据《人民检察院刑事诉讼规则》第三百八十七条，被不起诉人如对不起诉决定（包括存疑不起诉决定）有异议，可在收到决定书后七日以内向作出决定的人民检察院提出申诉。这一规定明确赋予了被不起诉人在存疑不起诉情形下的申诉权利。

2. 申诉流程与处理：

   • 被不起诉人提出申诉时，应当递交申诉书，写明申诉理由。若没有书写能力，也可以口头提出申诉，人民检察院会根据其口头提出的申诉制作笔录。
   • 人民检察院应受理并复查申诉，作出复查决定后通知被不起诉人，并抄送公安机关。这一流程确保了被不起诉人的申诉能够得到及时、有效的处理。

3. 申诉的意义与目的：

   • 申诉是被不起诉人维护自身合法权益的重要途径。通过申诉，被不起诉人可以表达对存疑不起诉决定的不满，并提供新的证据或线索，以争取公正的裁决。
   • 同时，申诉也有助于检察机关对案件进行再次审查，确保案件处理的公正性和准确性。

4. 实际操作中的建议：

   • 对于被不起诉人而言，在提出申诉前，应充分了解相关法律法规和申诉流程，确保自己的申诉符合法律要求。
   • 在申诉过程中，被不起诉人应积极配合检察机关的调查工作，提供真实、有效的证据和线索，以支持自己的申诉请求。
   • 若对申诉结果仍不满意，被不起诉人还可以考虑通过其他法律途径维护自己的权益，如向上一级人民检察院申请复查或向人民法院提起诉讼（但需注意，在存疑不起诉的情形下，被不起诉人直接向人民法院提起诉讼的情况较为罕见，通常需基于新的证据或事实）。

总结与提醒：存疑不起诉并不意味着案件的终结，被不起诉人仍享有申诉的权利。在处理此类问题时，建议被不起诉人充分了解相关法律法规和申诉流程，并在必要时寻求专业法律帮助以确保自身权益得到有效维护。如果你有任何具体的法律问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。