不同项目工程款多付是否可以互抵，以及是否合法，这主要取决于双方之间的合同约定以及相关法律法规的规定，不能一概而论。以下从几个角度进行详细分析：

1. 合同约定角度：

   • 如果双方在合同中明确约定了工程款多付可以互抵的条款，或者双方事后达成了互抵的协议，并且这种约定或协议不违反法律法规的强制性规定，那么这种互抵行为是合法的，双方应当按照约定履行。
   • 例如，如果两个项目之间存在关联，且双方同意将一个项目多付的工程款用于抵扣另一个项目未付的工程款，这种约定在法律上是有效的。

2. 法律法规角度：

   • 在没有合同约定或约定不明确的情况下，工程款多付是否可以互抵，需要依据相关法律法规来判断。
   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，债务的抵销应当符合法定条件，如双方互负债务、债务的标的物种类和品质相同等。如果工程款多付的情况符合这些条件，且双方没有异议，那么理论上是可以进行互抵的。
   • 但需要注意的是，如果工程款多付是由于一方的过错（如计算错误、重复支付等）导致的，且另一方对此存在过错或恶意利用，那么这种互抵可能会受到法律的限制或禁止。

3. 实际操作角度：

   • 在实际操作中，工程款多付互抵可能会涉及复杂的财务和法律问题，如税务处理、合同变更、债权债务转移等。
   • 因此，即使双方同意互抵，也建议咨询专业律师或会计师的意见，以确保互抵行为的合法性和有效性，避免后续产生纠纷。

4. 风险防范角度：

   • 为了避免工程款多付互抵带来的风险，双方在签订合同时应当明确约定工程款的支付方式、时间、条件等，以及多付或少付情况下的处理方式。
   • 同时，双方应当建立完善的财务和合同管理制度，定期核对账目，确保工程款的准确支付和及时结算。

建议：

• 如果您面临不同项目工程款多付互抵的问题，首先应当查看双方之间的合同约定，了解是否有相关条款或协议。
• 如果没有合同约定或约定不明确，建议咨询专业律师的意见，了解相关法律法规的规定和实际操作中的注意事项。
• 在进行互抵操作时，务必确保合法合规，避免后续产生纠纷和法律风险。

如果您有任何具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。