法院确认亲子关系不存在的判决书，其起诉案由通常为“否认亲子关系纠纷”。以下是对此问题的详细分析：

一、案由的确定

在民事诉讼中，案由是案件性质和内容的概括与提炼，它反映了当事人之间争议的法律关系及其性质。对于法院确认亲子关系不存在的案件，其核心争议在于亲子关系的真实性，即一方当事人（通常是被告）是否为另一方当事人（通常是原告）的生物学父母。因此，此类案件的案由被确定为“否认亲子关系纠纷”。

二、法律依据

虽然直接的案由规定可能并未在所有法律法规中明确提及，但根据《中华人民共和国民法典》中关于亲子关系的相关规定，以及民事诉讼中关于案由确定的一般原则，可以合理推断出此类案件的案由。特别是《民法典》中关于亲子关系确认和否认的规定，为此类案件提供了法律基础。例如，《民法典》第一千零七十三条规定：“对亲子关系有异议且有正当理由的，父或者母可以向人民法院提起诉讼，请求确认或者否认亲子关系。对亲子关系有异议且有正当理由的，成年子女可以向人民法院提起诉讼，请求确认亲子关系。”这一条款明确规定了亲子关系确认和否认的诉讼权利，也间接支持了“否认亲子关系纠纷”作为案由的合理性。

三、诉讼流程与注意事项

1. 提起诉讼：原告（通常是认为亲子关系不存在的当事人）需要向法院提交起诉状，明确诉讼请求（即否认亲子关系）和事实理由，并附上相关证据材料。

2. 证据提交：在诉讼过程中，原告需要提供充分的证据来支持其否认亲子关系的请求。这些证据可能包括但不限于DNA鉴定报告、证人证言、相关书面材料等。

3. 法院审理：法院将依法对案件进行审理，包括审查证据、听取双方当事人的陈述和辩论等。在审理过程中，法院可能会委托专业的鉴定机构进行DNA鉴定等科学鉴定，以确定亲子关系的真实性。

4. 判决结果：根据审理结果，法院将作出判决。如果法院认定亲子关系不存在，将出具确认亲子关系不存在的判决书。

四、法律后果

一旦法院出具确认亲子关系不存在的判决书，将产生以下法律后果：

1. 亲子关系解除：被判决否认的亲子关系将不再具有法律效力，双方当事人将不再承担基于亲子关系的法律义务和责任。

2. 财产分割与继承权：亲子关系的解除可能影响财产分割和继承权的行使。例如，在离婚财产分割中，如果亲子关系被否认，那么与该子女相关的财产分割和继承权问题将需要重新考虑。

3. 社会关系调整：亲子关系的解除还可能对当事人的社会关系产生影响，如家庭关系、社会声誉等。因此，在提起此类诉讼前，当事人应充分考虑其可能带来的社会后果。

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