在行人负主责、司机负次责的情况下，停运期间货车的损失一般可通过以下方式处理：

1. 保险理赔：

   • 交强险：司机可首先通过交强险向保险公司申请赔偿。交强险在有责情况下，对财产损失的赔偿限额通常为2000元。这部分赔偿可用于覆盖货车因事故造成的部分停运损失，如车辆维修费用等直接损失。
   • 商业险：如果司机购买了商业第三者责任险，且保险合同中包含了停运损失等间接损失的赔偿条款，那么司机还可以向保险公司申请更全面的赔偿。但需注意，很多商业险合同中可能将停运损失列为免责条款，因此需仔细审查合同内容。

2. 与行人协商赔偿：

   • 在行人负主责的情况下，司机有权要求行人按照责任比例赔偿其因事故造成的停运损失。这包括货车在停运期间的租金损失、司机因无法工作而减少的收入等间接损失。
   • 协商时，司机应提供充分的证据证明其停运损失的具体数额，如维修记录、租金合同、收入证明等。

3. 法律诉讼：

   • 如果协商无果，司机可以选择通过法律途径解决争议。司机可以向法院提起诉讼，要求行人按照责任比例赔偿其停运损失。
   • 在诉讼过程中，司机需要提供充分的证据证明其损失的具体数额以及行人的责任比例。法院将根据双方提供的证据和法律规定，作出公正的判决。

额外建议：

• 保留证据：司机在处理事故和停运损失时，应妥善保留所有相关证据，如事故认定书、维修记录、租金合同、收入证明等。这些证据将在协商和诉讼过程中发挥重要作用。
• 及时咨询：由于法律问题的复杂性和专业性，司机在处理此类事故时，建议及时向我咨询，以便更好地了解自己的权利和义务，以及如何更有效地维护自己的合法权益。